209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1231 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1231  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
268 aa  546  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 
268 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  57.04 
 
 
164 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 
270 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  32.59 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  34.98 
 
 
262 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  35.04 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  30.98 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.96 
 
 
269 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  34.4 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1656  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.86 
 
 
267 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  31.5 
 
 
291 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.87 
 
 
285 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  31.1 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2688  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  30.04 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  29.37 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  29.21 
 
 
291 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  30.39 
 
 
281 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  29.09 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  30.88 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  29.81 
 
 
283 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 
287 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2542  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 
269 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000099187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 
286 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.38 
 
 
267 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.88 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.62 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.84 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  29.78 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  38.29 
 
 
280 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  31.47 
 
 
254 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  31.14 
 
 
299 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  33.21 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  39.31 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
296 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  29.1 
 
 
282 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  30.24 
 
 
255 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  30.65 
 
 
255 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 
289 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  27.43 
 
 
272 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  28.2 
 
 
274 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4086  transcriptional regulator, XRE family  30.35 
 
 
272 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  31.02 
 
 
289 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  30.07 
 
 
284 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  29.06 
 
 
284 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  35.75 
 
 
283 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  26.81 
 
 
288 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1874  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 
267 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  29.26 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
278 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  27.96 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  27.54 
 
 
288 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  27.44 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 
290 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3156  helix-turn-helix domain protein  28.47 
 
 
272 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.263344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.35 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 
288 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2769  transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 
271 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310894  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.67 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  26.74 
 
 
410 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 
296 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  25.9 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  27.24 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  25.27 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  30.57 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  31.46 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  27.48 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  31.4 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  32.99 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  27.4 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  29.79 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  26.26 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  26.45 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6444  putative transcriptional regulator, XRE family  27.04 
 
 
380 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504715  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  28.06 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  28.68 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  29.13 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  26.46 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20570  Helix-turn-helix protein  24.81 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.936379 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  24.31 
 
 
270 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  28 
 
 
282 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  26.59 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  28.73 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  28 
 
 
295 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.71 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>