More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1150 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 363 aa  722    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  76.31 
 
 		 359 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  73.96 
 
 		 370 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  72.73 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  72.02 
 
 		 368 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  69.13 
 
 		 365 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.87 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  69.17 
 
 		 363 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  66.48 
 
 		 376 aa  454  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.93 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.23 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.87 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.87 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  63.54 
 
 		 363 aa  424  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.87 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.4 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  63.46 
 
 		 368 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.77 
 
 		 328 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.02 
 
 		 618 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.71 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  63.64 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  63.09 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.35 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  60.49 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.27 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.05 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.72 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  61.37 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  57.1 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  59.04 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  58.09 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  69.42 
 
 		 285 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  59.03 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  61.76 
 
 		 382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  51.83 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.8 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.86 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  38.71 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  34.75 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  37.13 
 
 		 399 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.45 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.41 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.47 
 
 		 388 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  31.95 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.93 
 
 		 402 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.02 
 
 		 388 aa  169  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.03 
 
 		 391 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.95 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  37.09 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  39.61 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.71 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  34.01 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  31.85 
 
 		 394 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  31.85 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  33.07 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  35.82 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  30.29 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 		 399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  33.8 
 
 		 388 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  30.87 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  32.9 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  33.52 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.04 
 
 		 390 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.45 
 
 		 400 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  35.46 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  33.33 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.92 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  36.89 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  33.52 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0146  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126801  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0165  aspartate aminotransferase  29.77 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  32.82 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.76 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  30.33 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  31.93 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  33.08 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  34.1 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  32.63 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  36.49 
 
 		 398 aa  155  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  33.52 
 
 		 397 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  35.44 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  31.3 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.13 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.61 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  35.13 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0506  aminotransferase  32.5 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0194715  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  33.52 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  31.51 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  34.93 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>