68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1061 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  35.92 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  46.59 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  35.4 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  46.91 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  35.33 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  30.93 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  35.1 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  32.95 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  33.61 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  34.27 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  31.94 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  30.28 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  32.45 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  42.05 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  25.53 
 
 		 264 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  28.85 
 
 		 152 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  40 
 
 		 175 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  41.67 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  32.73 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.86 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  32.28 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  31.25 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  32.61 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  31.05 
 
 		 393 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  36.56 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  22.33 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  27.27 
 
 		 424 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  37.25 
 
 		 415 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  37.25 
 
 		 415 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  32 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  26.95 
 
 		 159 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  36.03 
 
 		 375 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  37.25 
 
 		 412 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  37.25 
 
 		 412 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 449 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 444 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 448 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  36.27 
 
 		 398 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  36.11 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  37.04 
 
 		 414 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  29.25 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  40.23 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  27.63 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  37.62 
 
 		 424 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  30.92 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  27.63 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  30.26 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  37.8 
 
 		 453 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  29.38 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  40.23 
 
 		 375 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.62 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  31.94 
 
 		 668 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  25.47 
 
 		 158 aa  42.7  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  32.67 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  28.3 
 
 		 135 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  35.64 
 
 		 166 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  30.71 
 
 		 138 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  27.5 
 
 		 316 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  27.46 
 
 		 156 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0732  RDD domain-containing protein  27.52 
 
 		 248 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.70222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  28.66 
 
 		 131 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>