20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0964 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  38.67 
 
 
347 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  32.84 
 
 
308 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  32.62 
 
 
856 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  34.64 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  32.43 
 
 
751 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  29.79 
 
 
246 aa  75.5  6e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  33.33 
 
 
524 aa  72  7e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  31.87 
 
 
205 aa  70.1  3e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 
513 aa  66.6  3e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  29.73 
 
 
351 aa  66.2  4e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  27.57 
 
 
247 aa  63.9  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  31.47 
 
 
209 aa  60.8  1e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  29.41 
 
 
256 aa  59.7  3e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4519  hypothetical protein  30.27 
 
 
239 aa  60.1  3e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  30.05 
 
 
258 aa  56.2  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  29.52 
 
 
464 aa  55.1  9e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  31.77 
 
 
235 aa  51.6  9e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.39593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  28.04 
 
 
282 aa  48.5  9e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  33.67 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>