More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0928 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  100 
 
 		 167 aa  338  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  55.42 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  54.49 
 
 		 164 aa  174  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 191 aa  167  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  64.46 
 
 		 171 aa  167  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  63.64 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  63.11 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  50.58 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  49.44 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  61.48 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  51.5 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  51.5 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  64.71 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  49.1 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  60.66 
 
 		 188 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  62.3 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  48.02 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  48.26 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 		 170 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  48.82 
 
 		 166 aa  153  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  63.11 
 
 		 182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  58.2 
 
 		 189 aa  150  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  49.12 
 
 		 300 aa  150  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  59.02 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  58.2 
 
 		 182 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  58.2 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  55.12 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  58.2 
 
 		 200 aa  147  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  56.56 
 
 		 175 aa  147  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  56.56 
 
 		 193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  56.56 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  56.56 
 
 		 193 aa  144  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  54.1 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  55.74 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  51.64 
 
 		 198 aa  137  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  52.73 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  50.78 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  47.06 
 
 		 193 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  45.38 
 
 		 218 aa  117  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  38.12 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  46.22 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  42.07 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  43.09 
 
 		 305 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  40.65 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  34.84 
 
 		 191 aa  84.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  39.6 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  39.6 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  39.6 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  32.56 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  37.61 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  37 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  36.62 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  35.64 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  34.65 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  43.16 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  30.28 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  40.2 
 
 		 181 aa  70.5  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  33.66 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>