More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0717 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
285 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2450  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  52.28 
 
 
204 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2328  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  51.81 
 
 
205 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.452351  hitchhiker  0.00271945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
249 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  33.6 
 
 
253 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
250 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 
257 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  30.04 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 
259 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 
255 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.87 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7034  putative transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
241 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.03 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
139 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  28.16 
 
 
231 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  28.99 
 
 
231 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  28.99 
 
 
231 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  28.99 
 
 
231 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
85 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  46.03 
 
 
366 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  28.57 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  28.43 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  28.43 
 
 
231 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  23.26 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  46.77 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  23.64 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 
237 aa  59.3  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 
139 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.27 
 
 
231 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  22.53 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.1 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  25.86 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  42.19 
 
 
86 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  28.57 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  27.1 
 
 
234 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
145 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3786  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3837  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 
255 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10255  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  40.62 
 
 
83 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1672  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.21 
 
 
435 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  27.27 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  42.65 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  38.1 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  28.74 
 
 
478 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  25.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3704  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.636639  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
100 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 
480 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  44.12 
 
 
484 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 
480 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  26.42 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  46.15 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
233 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  23.48 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  26.89 
 
 
233 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  26.61 
 
 
235 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  25.39 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  38.1 
 
 
480 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>