246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0655 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
328 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  63.45 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  66.46 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  62.39 
 
 
352 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  59.88 
 
 
340 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  60.54 
 
 
335 aa  356  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  61.8 
 
 
324 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.81 
 
 
360 aa  328  9e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.02 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  49.86 
 
 
369 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.02 
 
 
385 aa  295  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  51.36 
 
 
379 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50 
 
 
361 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  48.2 
 
 
389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  52.15 
 
 
369 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  51.12 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  48.63 
 
 
368 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  48.55 
 
 
364 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  48.86 
 
 
396 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  50 
 
 
361 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.87 
 
 
369 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  43.94 
 
 
376 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.09 
 
 
369 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  48.8 
 
 
386 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  44.42 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  49.67 
 
 
349 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  44.34 
 
 
389 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  44.8 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.17 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  43.17 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  43.17 
 
 
356 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.22 
 
 
367 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.98 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  43.54 
 
 
368 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  39.59 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  64.52 
 
 
409 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  27.67 
 
 
342 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  47.29 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.96 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.52 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.8 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  30.07 
 
 
293 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  28.7 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  29.01 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.44 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  31.64 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  29.32 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.81 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  29.52 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0262  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  34.73 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00715457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.97 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.04 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  27.56 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.52 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.52 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.04 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  29.07 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_002978  WD0309  aminomethyl transferase family protein  25.63 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  30.89 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  27.08 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  31.21 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  27.8 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  29.15 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  28.83 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.3 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2940  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.02 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.352014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  29.18 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  28.15 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  30.24 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.57 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  28.78 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.33 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  26.97 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2152  glycine cleavage T-protein superfamily protein  29.55 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1427  hypothetical protein  29.31 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2445  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  29.31 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  25.19 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1918  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  29.31 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.33 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3386  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  29.31 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2283  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  29.31 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1191  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  29.31 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.52 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1041  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  25.09 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255858  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.96 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.42 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.47 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.59 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2322  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  28.97 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0667  aminomethyltransferase, putative  23.22 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  30.26 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.35 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0660  folate-binding protein YgfZ  23.22 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.439221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1895  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  24.36 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  26.06 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1379  folate-binding protein YgfZ  27.82 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  28.4 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>