127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0628 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 505 aa  991    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  41.76 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  45.33 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  42.91 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  39.8 
 
 		 304 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  35.67 
 
 		 306 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 		 348 aa  153  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  39.36 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 		 341 aa  120  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.75 
 
 		 315 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.87 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 		 340 aa  87.4  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.93 
 
 		 524 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.24 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.34 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.47 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  28.02 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  28.75 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.33 
 
 		 337 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.38 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  24.01 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  25.22 
 
 		 699 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  28.33 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.61 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.28 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  25.88 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  28.32 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  28.1 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  29.74 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.17 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.87 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.72 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  30.06 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  30.03 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  25.55 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 475 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.92 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  26.72 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  40.18 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.05 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.31 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  25 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  24.09 
 
 		 804 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.68 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  32.67 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  26.18 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  25.74 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  27 
 
 		 703 aa  55.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.06 
 
 		 707 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  27.27 
 
 		 527 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 315 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.74 
 
 		 327 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  26.92 
 
 		 494 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.91 
 
 		 566 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  44.44 
 
 		 464 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.62 
 
 		 401 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  27.04 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.64 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  24.74 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  25.79 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  26.75 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.47 
 
 		 538 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.57 
 
 		 712 aa  50.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  29.39 
 
 		 550 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 581 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.29 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.19 
 
 		 352 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.41 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  28.95 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.29 
 
 		 577 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  23.9 
 
 		 789 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.57 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  26.57 
 
 		 542 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  26.81 
 
 		 496 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.47 
 
 		 539 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  41.33 
 
 		 450 aa  47  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.4 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 1112 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>