60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0499 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  100 
 
 
142 aa  283  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  63.91 
 
 
136 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  60.9 
 
 
135 aa  167  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  58.96 
 
 
145 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  60.15 
 
 
135 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50 
 
 
147 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  50 
 
 
147 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  50 
 
 
147 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  55.8 
 
 
201 aa  134  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  44.44 
 
 
164 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.96 
 
 
225 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.06 
 
 
155 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.6 
 
 
139 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.6 
 
 
139 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  40.6 
 
 
139 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  45.93 
 
 
152 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.72 
 
 
136 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.86 
 
 
140 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  40.15 
 
 
225 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  43.09 
 
 
151 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  42.28 
 
 
147 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  40.15 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  42.11 
 
 
179 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  40.15 
 
 
224 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  40.69 
 
 
236 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  41.09 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  40.6 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  42.54 
 
 
140 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.65 
 
 
142 aa  94  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  40.46 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  40.91 
 
 
223 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  39.85 
 
 
190 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  40.6 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  38.64 
 
 
177 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  40.6 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.51 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  38.21 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.71 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6100  hypothetical protein  42.11 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  38.33 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.37 
 
 
156 aa  84  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  37.4 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  34.4 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  41.46 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4835  hypothetical protein  38.17 
 
 
155 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.3 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  35.61 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  31.45 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  34.85 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  37.82 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  30 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0999  hypothetical protein  39.06 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  30.95 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13150  hypothetical protein  34.83 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.07 
 
 
142 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1106  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.95 
 
 
216 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.97 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000305005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1135  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.62 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.551955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>