24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0492 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  698    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  38.67 
 
 
231 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  33.88 
 
 
308 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 
513 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  33.48 
 
 
856 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  32.97 
 
 
281 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  35.68 
 
 
246 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  36.71 
 
 
751 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  31.44 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4519  hypothetical protein  32.69 
 
 
239 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  28.38 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  29.63 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  28.65 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  30.05 
 
 
524 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  28.65 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  30.39 
 
 
235 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  28.04 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0633  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  25.1 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  26.03 
 
 
258 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1166  hypothetical protein  28.37 
 
 
227 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  25.76 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5505  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1602  hypothetical protein  27.27 
 
 
499 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>