More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0347 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  100 
 
 
229 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  60.73 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1745  ABC transporter related  55.41 
 
 
229 aa  231  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289299  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3626  ABC transporter related  57.47 
 
 
233 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118592  hitchhiker  0.00961975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4150  ABC transporter related  56.82 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
223 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
223 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
223 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
223 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
223 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
223 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  44.34 
 
 
223 aa  214  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3383  ABC transporter related  54.26 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1933  hypothetical protein  53.88 
 
 
236 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.84 
 
 
228 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  46.36 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  44.29 
 
 
223 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4603  ABC transporter related  52.68 
 
 
229 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.609954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  47.83 
 
 
243 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.78 
 
 
252 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  44.09 
 
 
244 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  44.1 
 
 
241 aa  191  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  46.36 
 
 
245 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.31 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  45.21 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  45.21 
 
 
236 aa  188  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  45.21 
 
 
236 aa  188  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  46.12 
 
 
236 aa  188  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
246 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  42.13 
 
 
248 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  45.21 
 
 
236 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  42.13 
 
 
248 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.45 
 
 
265 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  44.14 
 
 
244 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  44.55 
 
 
234 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  43.64 
 
 
228 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  46.36 
 
 
234 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  43.84 
 
 
236 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  45.21 
 
 
236 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  45.21 
 
 
236 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  45.21 
 
 
236 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
236 aa  184  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.25 
 
 
277 aa  184  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.37 
 
 
239 aa  184  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.89 
 
 
237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  41.89 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  42.99 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  45.05 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.91 
 
 
232 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  43.52 
 
 
244 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  44.13 
 
 
240 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  44.24 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
226 aa  181  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  40.19 
 
 
240 aa  182  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
233 aa  180  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
241 aa  180  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
238 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.37 
 
 
226 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2485  ABC transporter related  52.91 
 
 
232 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0651372  normal  0.613414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  47.51 
 
 
707 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  45.61 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  38.81 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  45.93 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  45.91 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  38.81 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  45.24 
 
 
240 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  41.82 
 
 
244 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2884  ABC transporter related protein  48.03 
 
 
250 aa  177  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
253 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
244 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  42.59 
 
 
260 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.99 
 
 
644 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  42.66 
 
 
228 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 
230 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.26 
 
 
280 aa  175  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  50.49 
 
 
236 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
227 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40 
 
 
230 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.98 
 
 
253 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  38.36 
 
 
223 aa  175  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  42.99 
 
 
249 aa  175  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
246 aa  175  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  42.2 
 
 
253 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  42.92 
 
 
231 aa  175  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  43.72 
 
 
246 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  42.22 
 
 
249 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  42.72 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  44.5 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  39.91 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  41.2 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  44.74 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  44.91 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  46.7 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>