41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0344 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  100 
 
 
437 aa  898    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  63.25 
 
 
401 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  50.92 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  51.1 
 
 
414 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  47.14 
 
 
434 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  46.45 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  38.17 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  37.33 
 
 
390 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  36.47 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  35.21 
 
 
394 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  35.09 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  35.93 
 
 
405 aa  206  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  32.94 
 
 
414 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  34.48 
 
 
378 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  28.68 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.93 
 
 
397 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  32.02 
 
 
435 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  29.46 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.35 
 
 
396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  31.13 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.29 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  32.05 
 
 
428 aa  103  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  31.62 
 
 
428 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  31.62 
 
 
435 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  31.2 
 
 
442 aa  100  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  24.07 
 
 
454 aa  99.8  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  21.36 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.05 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  23.1 
 
 
421 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.53 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.25 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  20.67 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.42 
 
 
315 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.96 
 
 
315 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.1 
 
 
385 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  24.75 
 
 
317 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  26.74 
 
 
337 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  27.7 
 
 
374 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3916  periplasmic binding protein  27.04 
 
 
376 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225545  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27076  predicted protein  23.81 
 
 
505 aa  43.5  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000736705  hitchhiker  0.0000360443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  23.74 
 
 
348 aa  43.1  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>