64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0305 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  48.24 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  42.9 
 
 
324 aa  222  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  44.19 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  42.75 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  37.1 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  35.15 
 
 
349 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  71.3 
 
 
364 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  37.2 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  34.71 
 
 
336 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  32.72 
 
 
324 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  31.01 
 
 
340 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  24.62 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  24.46 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  27.41 
 
 
358 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  54.55 
 
 
1048 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  26.38 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  34.45 
 
 
434 aa  86.3  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  25.36 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  39.02 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  33.79 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  23.72 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  34.17 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.52 
 
 
547 aa  76.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  24.36 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.09 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.96 
 
 
554 aa  73.6  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  32.8 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  43.01 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  42.42 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  39.45 
 
 
682 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  27.27 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  32.17 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  35.35 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  34.21 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  35.35 
 
 
437 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  34.21 
 
 
220 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  24.39 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  34.78 
 
 
216 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  34.11 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  34.11 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  34.11 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  33.64 
 
 
171 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  33.64 
 
 
171 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  30.09 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  30.09 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  30.09 
 
 
365 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  38.82 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  24.82 
 
 
366 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  30 
 
 
1050 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  35.42 
 
 
767 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  26.67 
 
 
220 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  23.27 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  25.42 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  31.25 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  31.25 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  31.25 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  25.65 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  25 
 
 
350 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  29.66 
 
 
234 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  20.69 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  28.77 
 
 
331 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  29.37 
 
 
232 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>