More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0288 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
361 aa  698    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.49 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  68.72 
 
 
396 aa  441  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  66.2 
 
 
355 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  62.88 
 
 
389 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.76 
 
 
356 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.76 
 
 
356 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.76 
 
 
356 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  58.29 
 
 
360 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.52 
 
 
356 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  60.73 
 
 
357 aa  381  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  61.67 
 
 
366 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2406  dihydroorotate dehydrogenase  61.14 
 
 
376 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.06 
 
 
353 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  62.12 
 
 
370 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.86 
 
 
357 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  58.03 
 
 
355 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.83 
 
 
353 aa  348  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2435  dihydroorotate dehydrogenase  58.21 
 
 
375 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12260  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.15 
 
 
375 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16390  dihydroorotate oxidase A  56.02 
 
 
367 aa  318  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  46.18 
 
 
339 aa  305  6e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  47.78 
 
 
355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  50.6 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.19 
 
 
344 aa  302  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 
361 aa  301  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  49.86 
 
 
363 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  48.13 
 
 
349 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.09 
 
 
343 aa  296  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.59 
 
 
349 aa  295  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 
348 aa  295  7e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.85 
 
 
364 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 
340 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.42 
 
 
364 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.7 
 
 
364 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.43 
 
 
363 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2095  dihydroorotate dehydrogenase  53.01 
 
 
354 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1463  dihydroorotate dehydrogenase  49.16 
 
 
348 aa  286  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.65 
 
 
364 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.03 
 
 
356 aa  285  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  50.45 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.24 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  49.72 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.99 
 
 
362 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  47.76 
 
 
346 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.04 
 
 
361 aa  282  8.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  45.37 
 
 
336 aa  281  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.29 
 
 
347 aa  281  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.27 
 
 
364 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.27 
 
 
364 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.86 
 
 
351 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 
342 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  46.13 
 
 
356 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  48.29 
 
 
361 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.58 
 
 
351 aa  278  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  48.81 
 
 
342 aa  278  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.84 
 
 
362 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.18 
 
 
378 aa  277  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  47.08 
 
 
348 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  48.8 
 
 
340 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.76 
 
 
360 aa  276  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  51.53 
 
 
375 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 
362 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 
341 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.02 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.69 
 
 
342 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  44.85 
 
 
384 aa  272  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.05 
 
 
336 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.22 
 
 
363 aa  272  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.77 
 
 
377 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.77 
 
 
362 aa  271  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.65 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.43 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  44.05 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.52 
 
 
377 aa  270  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.16 
 
 
378 aa  269  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.6 
 
 
350 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 
357 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.33 
 
 
336 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2026  dihydroorotate dehydrogenase  51.54 
 
 
354 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  44.88 
 
 
335 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.02 
 
 
337 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.25 
 
 
356 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.37 
 
 
369 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 
340 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.42 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.29 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  42.4 
 
 
377 aa  266  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.42 
 
 
354 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 
355 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 
339 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.54 
 
 
336 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.94 
 
 
342 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.88 
 
 
339 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  45.03 
 
 
344 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.39 
 
 
336 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>