12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0269 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0269  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  982    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6266  hypothetical protein  43.91 
 
 
523 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  40.45 
 
 
539 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0876  hypothetical protein  41.67 
 
 
704 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187127  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6989  hypothetical protein  29.69 
 
 
712 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7051  hypothetical protein  33.52 
 
 
814 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1699  hypothetical protein  26.33 
 
 
577 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38810  hypothetical protein  27.97 
 
 
776 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.707868  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2107  hypothetical protein  25 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0094  hypothetical protein  45.9 
 
 
125 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395549  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1821  hypothetical protein  26.9 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2323  hypothetical protein  26.01 
 
 
310 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>