91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0164 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  39.86 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  40.44 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  37.1 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  41.04 
 
 
817 aa  68.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.48 
 
 
1045 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.69 
 
 
1039 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.41 
 
 
549 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.82 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.81 
 
 
855 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  36.07 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  36.49 
 
 
697 aa  64.3  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.24 
 
 
573 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  35.43 
 
 
282 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
356 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  35.77 
 
 
591 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 
716 aa  61.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.3 
 
 
952 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
207 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  36.05 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.69 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 
143 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.65 
 
 
738 aa  57.8  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 
226 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.85 
 
 
616 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 
754 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0034  hypothetical protein  51.35 
 
 
236 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  37.86 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.58 
 
 
713 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.51 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 
216 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
355 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.81 
 
 
743 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
133 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 
744 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
122 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 
776 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.97 
 
 
745 aa  47.8  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  34.81 
 
 
722 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
214 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
171 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
122 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  27.71 
 
 
753 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.53 
 
 
750 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.09 
 
 
579 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  28.4 
 
 
765 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  32.62 
 
 
805 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4290  ATPase domain-containing protein  30.67 
 
 
315 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.814219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
146 aa  44.3  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  31.94 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  29.58 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  33.82 
 
 
365 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
347 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211721  hitchhiker  0.0066599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.54 
 
 
281 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  34.19 
 
 
470 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22960  histidine kinase  33.33 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573148  normal  0.329489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  35.9 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  32.16 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
251 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  32.9 
 
 
800 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  27.39 
 
 
249 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.85 
 
 
743 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0265  hypothetical protein  32.35 
 
 
163 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
137 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  32.24 
 
 
693 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 
728 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
142 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>