56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0125 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
104 aa  213  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  73.74 
 
 
103 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  55.56 
 
 
97 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  56.82 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  50.57 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  53.93 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 
105 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  68.54 
 
 
102 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  54.44 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  43.01 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  44.12 
 
 
102 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  45.56 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  41.11 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  39.77 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
98 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  41.05 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  48.89 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  36.78 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  41.05 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
117 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  36.56 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  34.41 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  36.67 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  28.12 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  29.21 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  30.34 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  31.63 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  32.26 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  25.27 
 
 
99 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 
120 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  26.88 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  30.49 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  31.18 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 
218 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  27.78 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  27.85 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  34.41 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  30.21 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  26.58 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  44.9 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  24.72 
 
 
327 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
326 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  30.34 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  41.46 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  42 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3463  ArsR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000113736  hitchhiker  0.007671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>