116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0096 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0096  Arginine deiminase  100 
 
 
397 aa  792  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6447  Arginine deiminase  71.57 
 
 
401 aa  573  1e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4517  arginine deiminase  69.5 
 
 
419 aa  538  1e-152  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5027  arginine deiminase  70 
 
 
436 aa  540  1e-152  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0245  Arginine deiminase  69.44 
 
 
407 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0166  arginine deiminase  67.33 
 
 
407 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0083  arginine deiminase  68.34 
 
 
415 aa  516  1e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4362  arginine deiminase  67.09 
 
 
399 aa  507  1e-142  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0268184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4276  arginine deiminase  67.09 
 
 
399 aa  507  1e-142  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4655  arginine deiminase  67.09 
 
 
399 aa  507  1e-142  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1483  arginine deiminase  64.56 
 
 
417 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00980  arginine deiminase  66.58 
 
 
418 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1923  arginine deiminase  65.32 
 
 
402 aa  493  1e-138  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849208  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4810  arginine deiminase  66.58 
 
 
402 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11020  arginine deiminase  64.05 
 
 
402 aa  475  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00481648  normal  0.252626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2175  arginine deiminase  47.16 
 
 
407 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4646  arginine deiminase  44.5 
 
 
408 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03644  arginine deiminase  44.67 
 
 
406 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002421  arginine deiminase  43.89 
 
 
406 aa  326  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4751  arginine deiminase  45.57 
 
 
406 aa  320  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4869  arginine deiminase  45.57 
 
 
406 aa  320  4e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99557  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4814  arginine deiminase  45.57 
 
 
406 aa  320  4e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.514213  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4850  arginine deiminase  45.57 
 
 
406 aa  320  4e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4721  arginine deiminase  45.32 
 
 
406 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.160752 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6443  arginine deiminase  42.08 
 
 
417 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0452  arginine deiminase  46.31 
 
 
406 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0154087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2241  arginine deiminase  42.4 
 
 
408 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.420551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0058  arginine deiminase  42.43 
 
 
407 aa  314  1e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0521  arginine deiminase  43.14 
 
 
406 aa  310  3e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2128  arginine deiminase  41.36 
 
 
418 aa  308  7e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1987  arginine deiminase  41.36 
 
 
425 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0915  arginine deiminase  41.36 
 
 
425 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1145  arginine deiminase  41.36 
 
 
418 aa  308  7e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1968  arginine deiminase  41.36 
 
 
425 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0244  arginine deiminase  41.36 
 
 
418 aa  308  7e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.177329  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1585  arginine deiminase  41.36 
 
 
425 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593064  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5575  arginine deiminase  44.55 
 
 
405 aa  307  2e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1993  arginine deiminase  43.24 
 
 
409 aa  307  2e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5911  arginine deiminase  40.54 
 
 
418 aa  307  2e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4537  arginine deiminase  40.92 
 
 
418 aa  307  2e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.130916  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0483  arginine deiminase  41.58 
 
 
408 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.67571e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5202  arginine deiminase  43.03 
 
 
409 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2384  arginine deiminase  40.88 
 
 
418 aa  306  4e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68330  arginine deiminase  40.54 
 
 
418 aa  306  4e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0305167  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1090  arginine deiminase  39.27 
 
 
419 aa  302  6e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2842  arginine deiminase  43.14 
 
 
407 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1108  arginine deiminase  40.29 
 
 
416 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1975  arginine deiminase  40.44 
 
 
413 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0432  arginine deiminase  42 
 
 
409 aa  298  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.277961  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4223  arginine deiminase  41.46 
 
 
417 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2800  Arginine deiminase  42.23 
 
 
414 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551978  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1877  arginine deiminase  42.33 
 
 
405 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2684  arginine deiminase  39.27 
 
 
418 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5730  Arginine deiminase  41.75 
 
 
434 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4386  arginine deiminase  40.24 
 
 
418 aa  293  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  0.182376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0146  Arginine deiminase  42.16 
 
 
418 aa  293  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.152156  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1457  arginine deiminase  42.82 
 
 
410 aa  292  9e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00237571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2163  arginine deiminase  41.46 
 
 
410 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2424  arginine deiminase  41.65 
 
 
431 aa  289  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06650  arginine deiminase  41.19 
 
 
410 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.22198e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3384  amidinotransferase  40.81 
 
 
410 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3978  Arginine deiminase  41.93 
 
 
419 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1000  arginine deiminase  40.15 
 
 
419 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0746  arginine deiminase  43.14 
 
 
407 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0880775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1001  arginine deiminase  40 
 
 
417 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1038  arginine deiminase  40.24 
 
 
417 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0161  arginine deiminase  43.21 
 
 
413 aa  282  8e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2250  arginine deiminase  40.69 
 
 
411 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2715  arginine deiminase  39.95 
 
 
411 aa  279  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0157  arginine deiminase  43.7 
 
 
413 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2659  arginine deiminase  39.95 
 
 
411 aa  279  8e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0902  arginine deiminase  38.44 
 
 
406 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0348  arginine deiminase  39.71 
 
 
410 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1391  arginine deiminase  39.42 
 
 
417 aa  275  1e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00832109  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4898  arginine deiminase  39.31 
 
 
410 aa  273  5e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0472  arginine deiminase  39.46 
 
 
410 aa  273  5e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0420  arginine deiminase  39.31 
 
 
410 aa  273  5e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0445  arginine deiminase  36.76 
 
 
410 aa  270  3e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.29267e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0341  arginine deiminase  39.07 
 
 
410 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0407  arginine deiminase  39.07 
 
 
410 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.751468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0451  arginine deiminase  38.52 
 
 
410 aa  267  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12360  arginine deiminase  43.55 
 
 
410 aa  266  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1118  arginine deiminase  36.67 
 
 
414 aa  263  3e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00592031  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0153  arginine deiminase  38.75 
 
 
405 aa  263  5e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06020  arginine deiminase  40.88 
 
 
409 aa  260  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0089  arginine deiminase  36.48 
 
 
403 aa  257  2e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1949  arginine deiminase  38.25 
 
 
405 aa  257  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.74348e-05  normal  0.297072 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0258  Arginine deiminase  36.68 
 
 
401 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22360  arginine deiminase  39.15 
 
 
406 aa  256  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0181  Arginine deiminase  38.46 
 
 
405 aa  254  2e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0871  arginine deiminase  35.64 
 
 
410 aa  251  2e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0203728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01620  arginine deiminase  38.61 
 
 
407 aa  249  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  8.11385e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06540  arginine deiminase  38.37 
 
 
407 aa  248  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00222308  normal  0.406316 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02360  arginine deiminase  35.77 
 
 
417 aa  225  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0263165  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2490  Arginine deiminase  35.76 
 
 
420 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07960  arginine deiminase  33.25 
 
 
403 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.86602e-06 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf873  arginine deiminase  33 
 
 
409 aa  201  1e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0565  Arginine deiminase  31.35 
 
 
453 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0874  arginine deiminase  29.15 
 
 
377 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0439  Arginine deiminase  29.1 
 
 
428 aa  130  5e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>