26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0085 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  100 
 
 
90 aa  179  8e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  50.63 
 
 
90 aa  82  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  44.87 
 
 
186 aa  73.9  7e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  44.3 
 
 
160 aa  72.4  2e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  46.84 
 
 
90 aa  70.5  8e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  46.84 
 
 
90 aa  70.5  8e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  40.24 
 
 
160 aa  65.5  2e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  38.46 
 
 
166 aa  65.9  2e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  39.24 
 
 
160 aa  64.3  5e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  40.51 
 
 
160 aa  63.5  9e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  39.24 
 
 
160 aa  61.6  3e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  40.74 
 
 
160 aa  61.2  5e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  36.25 
 
 
161 aa  57.4  6e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  33.75 
 
 
160 aa  57.4  7e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  33.72 
 
 
177 aa  56.2  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  33.72 
 
 
177 aa  56.2  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  33.72 
 
 
177 aa  56.2  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  30 
 
 
154 aa  48.9  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.69154e-05  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  41.67 
 
 
166 aa  48.9  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  2.59945e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  41.67 
 
 
196 aa  48.5  3e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  30.77 
 
 
195 aa  47.8  5e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  32.05 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  30.99 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  34.29 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 
160 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>