More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0084 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
436 aa  821  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  79.37 
 
 
409 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  68.61 
 
 
386 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  58.16 
 
 
393 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  60.51 
 
 
395 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  67.2 
 
 
399 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  60.45 
 
 
404 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  60.3 
 
 
436 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  57.69 
 
 
394 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  57.91 
 
 
393 aa  357  2e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  57.95 
 
 
396 aa  349  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  59.55 
 
 
401 aa  335  9e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  62.07 
 
 
401 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  4.13782e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  52.77 
 
 
388 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  57.36 
 
 
415 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  57.06 
 
 
387 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  51.2 
 
 
388 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  49.06 
 
 
385 aa  276  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  51.6 
 
 
384 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 
384 aa  275  2e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 
384 aa  275  2e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  49.47 
 
 
373 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 
403 aa  196  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  37.47 
 
 
403 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 
414 aa  174  2e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  34.41 
 
 
427 aa  174  3e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 
400 aa  173  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
400 aa  166  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 
408 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.6 
 
 
407 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 
407 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.35 
 
 
407 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 
407 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.86 
 
 
407 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.35 
 
 
407 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 
407 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.1 
 
 
407 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 
412 aa  157  5e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.65 
 
 
393 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.65 
 
 
393 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 
399 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  30 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  29.79 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.75 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  30 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  1.29264e-07 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  30.49 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.75 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.49 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.36094e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.49 
 
 
399 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.49 
 
 
399 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 
405 aa  148  2e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
782 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 
395 aa  140  4e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 
747 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 
411 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 
741 aa  132  2e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 
399 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.56939e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 
757 aa  130  5e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 
745 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 
585 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
587 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
586 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 
586 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 
586 aa  120  4e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.3 
 
 
587 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.9 
 
 
585 aa  119  1e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 
741 aa  119  1e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 
586 aa  118  2e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.61 
 
 
585 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.75 
 
 
585 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  29.56 
 
 
649 aa  117  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.8 
 
 
587 aa  116  9e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 
586 aa  115  1e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 
585 aa  114  2e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
391 aa  115  2e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.44506e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 
710 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 
653 aa  111  2e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  28.16 
 
 
650 aa  111  2e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
654 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  27.18 
 
 
648 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  27.18 
 
 
648 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  27.18 
 
 
648 aa  110  7e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 
741 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 
666 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
584 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.82 
 
 
648 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 
441 aa  106  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  3.79549e-08 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 
381 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 
656 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  27.18 
 
 
648 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  29.93 
 
 
649 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.75 
 
 
649 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.57 
 
 
648 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  29.5 
 
 
563 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  4.02209e-08 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 
673 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 
649 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 
659 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.73 
 
 
375 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.73 
 
 
375 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.73 
 
 
375 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>