70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0081 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  100 
 
 
103 aa  210  5e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  71.28 
 
 
106 aa  136  9e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  60.42 
 
 
104 aa  132  1e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  58.51 
 
 
98 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  56.12 
 
 
110 aa  112  2e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  55.21 
 
 
97 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  62.92 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  50 
 
 
102 aa  94  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  53.93 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  51.72 
 
 
109 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  52.87 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  54.55 
 
 
97 aa  88.6  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  54.26 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  47 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  46.24 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  42.86 
 
 
104 aa  82.8  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  45.56 
 
 
114 aa  80.5  7e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  36.08 
 
 
99 aa  79.3  2e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  44.21 
 
 
99 aa  78.6  3e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  43.82 
 
 
111 aa  78.2  4e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  34.74 
 
 
98 aa  77  9e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  45.56 
 
 
120 aa  76.3  1e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
103 aa  75.5  2e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
113 aa  75.1  3e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  39 
 
 
115 aa  74.3  5e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  38.04 
 
 
106 aa  73.9  7e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  42.86 
 
 
112 aa  73.9  7e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  38.64 
 
 
326 aa  73.9  8e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  47.73 
 
 
103 aa  72.8  1e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  35.42 
 
 
112 aa  73.2  1e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  38.64 
 
 
99 aa  72.4  2e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  34.07 
 
 
96 aa  71.6  3e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.54 
 
 
117 aa  72  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  51.09 
 
 
106 aa  71.2  5e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  36.96 
 
 
104 aa  70.9  5e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  39.24 
 
 
89 aa  70.9  6e-12  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  31.87 
 
 
99 aa  70.1  9e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  45.26 
 
 
102 aa  69.7  1e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 
126 aa  68.9  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  40.22 
 
 
126 aa  68.6  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  34.83 
 
 
327 aa  68.6  3e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  40.43 
 
 
101 aa  67  7e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  36.54 
 
 
120 aa  67.4  7e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  40.66 
 
 
101 aa  67.4  7e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 
332 aa  66.2  1e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  66.6  1e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  40.74 
 
 
119 aa  65.9  2e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 
120 aa  65.5  3e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 
99 aa  64.3  6e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
303 aa  63.5  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  31.82 
 
 
94 aa  63.5  1e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  62.4  2e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 
126 aa  62.4  2e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  33.7 
 
 
147 aa  61.6  3e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  33.7 
 
 
156 aa  61.6  4e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  33.7 
 
 
147 aa  61.6  4e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  33.75 
 
 
330 aa  60.8  6e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  60.5  7e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 
98 aa  57.8  5e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 
325 aa  57  8e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  30 
 
 
95 aa  56.6  1e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  28.26 
 
 
127 aa  52.8  1e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  30.67 
 
 
80 aa  53.1  1e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 
332 aa  52.4  2e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  30.34 
 
 
138 aa  51.6  4e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
101 aa  51.2  5e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  32.18 
 
 
95 aa  50.8  6e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  30.43 
 
 
129 aa  50.4  9e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>