More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0077 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  100 
 
 
272 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  58.17 
 
 
293 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  53.93 
 
 
284 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  56.76 
 
 
272 aa  243  2e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  54.51 
 
 
308 aa  233  2e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
292 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
259 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  52.78 
 
 
266 aa  213  2e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  47.62 
 
 
253 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  46 
 
 
271 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 
266 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 
266 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 
266 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  50 
 
 
274 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
272 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 
268 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  43.46 
 
 
424 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  44.09 
 
 
255 aa  189  3e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  9.29505e-13 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  47.2 
 
 
271 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 
255 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.08332e-07  hitchhiker  8.85497e-15 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
264 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.08 
 
 
261 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  44.88 
 
 
255 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  41.86 
 
 
260 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.09 
 
 
255 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  4.33574e-06  decreased coverage  1.13958e-08 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
253 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 
265 aa  184  1e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  40.71 
 
 
274 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.58 
 
 
424 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 
265 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  42.37 
 
 
269 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  42.75 
 
 
262 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.92 
 
 
264 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 
255 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 
255 aa  180  3e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  39.53 
 
 
255 aa  180  3e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  39.53 
 
 
255 aa  180  3e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
255 aa  180  3e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 
255 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  40.55 
 
 
259 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
255 aa  178  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  44.09 
 
 
255 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  44.22 
 
 
269 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
294 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  44.09 
 
 
255 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.51345e-05  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  40.47 
 
 
256 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  39.85 
 
 
266 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  37.45 
 
 
254 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  44.49 
 
 
419 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  39.2 
 
 
255 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
262 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 
255 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  2.62531e-09  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  46.81 
 
 
259 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  41.04 
 
 
270 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.23 
 
 
258 aa  175  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.33 
 
 
418 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.73 
 
 
266 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  40.48 
 
 
267 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  40 
 
 
268 aa  174  1e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 
266 aa  173  2e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  44.4 
 
 
267 aa  173  2e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  47.23 
 
 
260 aa  173  2e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  40.77 
 
 
262 aa  173  3e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  47.66 
 
 
260 aa  172  4e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  46.86 
 
 
260 aa  172  4e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.77 
 
 
405 aa  172  4e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.37 
 
 
262 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.94 
 
 
266 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  43.57 
 
 
255 aa  172  7e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  42.98 
 
 
261 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  46.84 
 
 
260 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  44.08 
 
 
255 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.9 
 
 
255 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  36.4 
 
 
265 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  37.98 
 
 
260 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  46.22 
 
 
260 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
266 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  39.09 
 
 
254 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  44.14 
 
 
260 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  38.61 
 
 
267 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
536 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  40.23 
 
 
286 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  43.01 
 
 
274 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.66 
 
 
259 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 
255 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  1.46988e-14 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  39.39 
 
 
263 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  36.65 
 
 
254 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  45.96 
 
 
271 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.32 
 
 
253 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  39.83 
 
 
414 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  41.73 
 
 
266 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  35.58 
 
 
268 aa  167  3e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.89 
 
 
409 aa  166  3e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  9.791e-05  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  34.25 
 
 
455 aa  166  3e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0846  ABC transporter related  36.18 
 
 
256 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  44.8 
 
 
268 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  47.62 
 
 
271 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  41.7 
 
 
266 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0869  ABC transporter related  36.18 
 
 
256 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  39.27 
 
 
269 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  4.77386e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>