26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0072 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0072  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  656  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0073  hypothetical protein  52.35 
 
 
270 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  52.54 
 
 
373 aa  127  2e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  55.56 
 
 
442 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  32.21 
 
 
543 aa  85.1  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  36.36 
 
 
525 aa  64.7  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0074  hypothetical protein  31.76 
 
 
214 aa  65.1  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2387  hypothetical protein  33.68 
 
 
262 aa  63.2  6e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  38.89 
 
 
471 aa  61.2  2e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  33.53 
 
 
492 aa  61.2  2e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  36.9 
 
 
445 aa  60.5  4e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  34.88 
 
 
215 aa  58.9  1e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09860  hypothetical protein  34.21 
 
 
333 aa  58.2  2e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0369  Htaa domain protein  31.39 
 
 
630 aa  56.6  5e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  37.39 
 
 
808 aa  53.5  5e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2762  hypothetical protein  28.83 
 
 
449 aa  53.1  6e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  32.89 
 
 
631 aa  53.1  7e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  36.55 
 
 
882 aa  52.4  1e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8824  hypothetical protein  37.59 
 
 
561 aa  51.6  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2876  hypothetical protein  31.89 
 
 
365 aa  50.4  4e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2986  hypothetical protein  34.11 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  31.25 
 
 
485 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0370  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.48 
 
 
515 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.556164  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3876  hypothetical protein  27.46 
 
 
444 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.814993  normal  0.0453755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  34.48 
 
 
615 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  30.19 
 
 
486 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>