More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0057 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  66.28 
 
 
174 aa  234  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  65.71 
 
 
175 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  66.67 
 
 
175 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  64.67 
 
 
174 aa  224  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  62.57 
 
 
178 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  64.97 
 
 
176 aa  220  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  62.72 
 
 
177 aa  211  6e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  66.86 
 
 
176 aa  205  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  61.05 
 
 
176 aa  204  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60 
 
 
179 aa  202  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.59 
 
 
176 aa  202  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  59.02 
 
 
193 aa  200  1e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  56.89 
 
 
188 aa  197  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  64.37 
 
 
176 aa  197  8e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  63.95 
 
 
182 aa  195  2e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  56.89 
 
 
188 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  63.95 
 
 
182 aa  195  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  58.48 
 
 
173 aa  192  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  56.11 
 
 
179 aa  192  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  61.05 
 
 
182 aa  188  3e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  53.25 
 
 
287 aa  187  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  57.49 
 
 
181 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
187 aa  184  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  61.31 
 
 
180 aa  183  1e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  61.54 
 
 
170 aa  182  2e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  56.9 
 
 
181 aa  181  4e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.77678e-13 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  58.86 
 
 
177 aa  181  5e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  60.69 
 
 
168 aa  180  8e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  60.69 
 
 
168 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  60.12 
 
 
168 aa  178  3e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
172 aa  178  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  51.48 
 
 
172 aa  177  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  57.99 
 
 
206 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
179 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  54.6 
 
 
181 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.28 
 
 
201 aa  174  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  60.24 
 
 
168 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  56.83 
 
 
184 aa  173  1e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  52.91 
 
 
266 aa  172  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  58.89 
 
 
179 aa  172  2e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  51.72 
 
 
178 aa  170  9e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  52.07 
 
 
241 aa  167  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  58.33 
 
 
175 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  58.33 
 
 
175 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  58.33 
 
 
175 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  60.36 
 
 
182 aa  167  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  61.4 
 
 
228 aa  165  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  59.28 
 
 
173 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  60.95 
 
 
177 aa  164  7e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  58.24 
 
 
172 aa  163  1e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  56.73 
 
 
178 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  59.3 
 
 
170 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.45 
 
 
378 aa  161  4e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.88 
 
 
376 aa  161  5e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  52.66 
 
 
657 aa  159  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.17 
 
 
189 aa  157  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  47.93 
 
 
571 aa  153  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  49.72 
 
 
181 aa  150  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.49 
 
 
218 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  52.98 
 
 
629 aa  149  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.98 
 
 
310 aa  147  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.97 
 
 
164 aa  146  1e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  47.19 
 
 
223 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.35 
 
 
310 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.82 
 
 
372 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  45.83 
 
 
629 aa  141  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.51 
 
 
230 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.51 
 
 
230 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  50.29 
 
 
179 aa  140  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  47.34 
 
 
665 aa  140  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  49.67 
 
 
310 aa  139  1e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
164 aa  137  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  49.1 
 
 
164 aa  135  3e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  53.1 
 
 
163 aa  134  1e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.93 
 
 
322 aa  131  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  43.27 
 
 
573 aa  131  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  40.91 
 
 
197 aa  131  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  47.24 
 
 
174 aa  130  7e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  53.15 
 
 
161 aa  130  7e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  47.37 
 
 
357 aa  129  2e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  44.77 
 
 
178 aa  129  2e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  49.66 
 
 
376 aa  129  2e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  45.22 
 
 
366 aa  128  4e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00680  conserved hypothetical protein  43.95 
 
 
155 aa  128  5e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.310644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  49.68 
 
 
172 aa  127  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.28 
 
 
160 aa  127  9e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  44.85 
 
 
184 aa  126  1e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  47.74 
 
 
254 aa  125  2e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.72 
 
 
196 aa  126  2e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.56 
 
 
195 aa  125  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  46.67 
 
 
222 aa  124  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1053  peptidylprolyl isomerase  47.02 
 
 
208 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.44097e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.94 
 
 
202 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1025  peptidylprolyl isomerase  47.68 
 
 
209 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.66369e-13  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  48.41 
 
 
372 aa  122  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_002936  DET1240  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  46.1 
 
 
209 aa  122  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  1.81585e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  42.69 
 
 
156 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  48.48 
 
 
169 aa  119  2e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04467  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B Precursor (PPIase B)(Rotamase B)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R3]  44.72 
 
 
214 aa  119  2e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.497778  normal  0.168508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>