26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0053 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  60.62 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  38.6 
 
 
216 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  33.9 
 
 
280 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  37.29 
 
 
254 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  30.04 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  35.38 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  33.63 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  32.34 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  34.08 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  32.64 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  30.87 
 
 
356 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  32.26 
 
 
358 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  32 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  32.79 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  32.74 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  31.73 
 
 
273 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  30.06 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  30.36 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  29.75 
 
 
270 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  32.46 
 
 
262 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  29.75 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  29.75 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  30 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  30 
 
 
271 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  30 
 
 
271 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>