More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0052 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
303 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  61.36 
 
 
311 aa  361  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  37.98 
 
 
265 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  41.41 
 
 
781 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  37.24 
 
 
262 aa  131  1e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  40.68 
 
 
251 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 
621 aa  129  7e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.68642e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  37.93 
 
 
265 aa  129  8e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  38.94 
 
 
852 aa  125  8e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.86 
 
 
253 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  35.34 
 
 
270 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  42.14 
 
 
263 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 
861 aa  111  1e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  34.36 
 
 
273 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 
442 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  32.89 
 
 
358 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  34.27 
 
 
337 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  38.61 
 
 
412 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  36.41 
 
 
766 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  33.04 
 
 
437 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  32.47 
 
 
444 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.2 
 
 
614 aa  100  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  32.97 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
416 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  34.81 
 
 
416 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  36.24 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  30.45 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  33.2 
 
 
444 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.56 
 
 
439 aa  95.9  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  34.44 
 
 
417 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.33 
 
 
468 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
1818 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  34.16 
 
 
351 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  28.52 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  30.36 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  36.94 
 
 
965 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  27.2 
 
 
923 aa  89  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
338 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 
319 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  28.03 
 
 
436 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  37.5 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  32.99 
 
 
447 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 
842 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  31.55 
 
 
1581 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  30.69 
 
 
433 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  29.47 
 
 
318 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  34.21 
 
 
312 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  27.47 
 
 
510 aa  85.5  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  31.22 
 
 
334 aa  85.5  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
308 aa  85.1  1e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1155  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 
328 aa  85.5  1e-15  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  26.75 
 
 
1049 aa  85.1  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0142  hypothetical protein  29.96 
 
 
633 aa  85.1  1e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0534916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  35 
 
 
291 aa  84  3e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  35.8 
 
 
442 aa  83.6  4e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  37.32 
 
 
329 aa  83.6  4e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 
367 aa  83.2  5e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.93 
 
 
437 aa  83.2  5e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  29.59 
 
 
1049 aa  82.8  6e-15  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.96 
 
 
506 aa  82.8  6e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  29.09 
 
 
330 aa  82.8  6e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  27.05 
 
 
312 aa  82.8  7e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.36 
 
 
314 aa  80.9  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  28.51 
 
 
1190 aa  81.3  2e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0142  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 
456 aa  81.6  2e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.741056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  29.15 
 
 
331 aa  80.1  4e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 
322 aa  80.1  4e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  29.86 
 
 
324 aa  80.1  5e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  32.97 
 
 
301 aa  80.1  5e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  79.7  6e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.18 
 
 
349 aa  79.7  6e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  37.5 
 
 
327 aa  79.7  6e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  79.7  6e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  33.52 
 
 
316 aa  79.3  8e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  30.04 
 
 
306 aa  79  9e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.46 
 
 
319 aa  78.6  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1012  hypothetical protein  28.44 
 
 
480 aa  78.6  1e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  34.34 
 
 
1064 aa  78.6  1e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  26.11 
 
 
1053 aa  79  1e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  27.83 
 
 
517 aa  77.8  2e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  29.28 
 
 
301 aa  78.2  2e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  26.97 
 
 
310 aa  77.8  2e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  77.8  2e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  30.58 
 
 
329 aa  78.2  2e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  28.79 
 
 
384 aa  77.4  3e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  26.22 
 
 
325 aa  77.4  3e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  30.32 
 
 
307 aa  76.6  4e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 
446 aa  77  4e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
1392 aa  77  4e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  29.09 
 
 
292 aa  76.6  4e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  29.73 
 
 
299 aa  76.6  5e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  29.8 
 
 
487 aa  76.3  6e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  29.3 
 
 
436 aa  76.3  6e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  29.28 
 
 
327 aa  76.3  6e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3081  XRE family transcriptional regulator  66.07 
 
 
81 aa  76.3  6e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.634194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  29.3 
 
 
436 aa  76.3  6e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  29.3 
 
 
436 aa  76.3  6e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  28.87 
 
 
481 aa  76.3  6e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>