222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0051 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  100 
 
 
259 aa  530  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  62.16 
 
 
259 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  51.94 
 
 
259 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  47.1 
 
 
262 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.72 
 
 
273 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  35.32 
 
 
271 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  34.36 
 
 
283 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  32.95 
 
 
271 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  37.01 
 
 
248 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  33.07 
 
 
272 aa  138  8e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  33.06 
 
 
270 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  32.26 
 
 
313 aa  134  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  33.47 
 
 
265 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  31.87 
 
 
281 aa  119  5e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  29.96 
 
 
283 aa  116  4e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  29.34 
 
 
285 aa  73.9  2e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  7.36742e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25.1 
 
 
282 aa  67  3e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  25.59 
 
 
292 aa  67  3e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  24.45 
 
 
250 aa  65.9  6e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  22.69 
 
 
241 aa  65.1  1e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  27.97 
 
 
271 aa  64.3  2e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  26.56 
 
 
304 aa  63.2  4e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  27.27 
 
 
271 aa  62.8  5e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  23.45 
 
 
244 aa  62.4  7e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  24.79 
 
 
304 aa  62.4  8e-09  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
298 aa  62  8e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
298 aa  62.4  8e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
298 aa  62  8e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
298 aa  62.4  8e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
298 aa  62  8e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
298 aa  61.6  1e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
298 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
298 aa  61.6  1e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.7 
 
 
298 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  24.79 
 
 
304 aa  61.6  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  23.24 
 
 
244 aa  60.5  3e-08  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  23.4 
 
 
306 aa  60.1  3e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  26.72 
 
 
306 aa  60.1  4e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  9.94351e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  24.79 
 
 
304 aa  60.1  4e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1802  aminotransferase class IV  26.24 
 
 
279 aa  59.3  5e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  25.95 
 
 
292 aa  58.9  7e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  24.3 
 
 
298 aa  58.9  7e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  24.89 
 
 
304 aa  59.3  7e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  24.89 
 
 
304 aa  59.3  7e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  26.4 
 
 
311 aa  58.5  1e-07  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  30.2 
 
 
588 aa  58.5  1e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  23.89 
 
 
269 aa  58.2  2e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  24.69 
 
 
312 aa  56.2  4e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  19.4 
 
 
246 aa  56.2  5e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  24.34 
 
 
286 aa  56.2  5e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  22.31 
 
 
292 aa  55.8  6e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  26.03 
 
 
310 aa  55.5  8e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  23.14 
 
 
304 aa  55.1  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  24.79 
 
 
308 aa  54.7  1e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  25.78 
 
 
310 aa  54.7  1e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  24.62 
 
 
274 aa  54.3  2e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
301 aa  54.3  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  23.55 
 
 
312 aa  54.3  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  26.02 
 
 
280 aa  53.9  3e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  24.39 
 
 
307 aa  53.1  4e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.9 
 
 
269 aa  53.5  4e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.22751e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  24.9 
 
 
269 aa  53.5  4e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.03186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  24.31 
 
 
306 aa  52.8  5e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  24.78 
 
 
289 aa  52.8  5e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  53.1  5e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  31.41 
 
 
290 aa  52.8  6e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  24.9 
 
 
269 aa  52.8  6e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  7.07213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  52.8  6e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  52.8  6e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  52.8  6e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  52.8  6e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  52.8  6e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  52.8  6e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.9 
 
 
269 aa  52.8  6e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  1.05414e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.9 
 
 
269 aa  52.8  6e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.50688e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.9 
 
 
269 aa  52.8  6e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  9.53076e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  52.8  6e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  23.24 
 
 
288 aa  52.4  7e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  23.85 
 
 
304 aa  52.4  7e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  23.33 
 
 
305 aa  52.4  7e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  8.96946e-06 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  27.72 
 
 
252 aa  52  8e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  26.67 
 
 
287 aa  52.4  8e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  23.96 
 
 
307 aa  52  9e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  23.35 
 
 
271 aa  52  9e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  22.55 
 
 
305 aa  51.6  1e-05  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  26.85 
 
 
269 aa  51.6  1e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.9 
 
 
269 aa  51.6  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.62113e-06  hitchhiker  2.1335e-13 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  26.85 
 
 
269 aa  51.2  2e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  24.51 
 
 
285 aa  50.8  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  50.8  2e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  22.41 
 
 
305 aa  50.8  2e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  23.75 
 
 
307 aa  50.8  2e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.26 
 
 
266 aa  51.2  2e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  25.69 
 
 
311 aa  50.8  2e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  27.42 
 
 
306 aa  51.2  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25 
 
 
269 aa  50.4  3e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.0849e-05  hitchhiker  9.35135e-06 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  23.44 
 
 
347 aa  50.1  3e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 
307 aa  50.4  3e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  26.85 
 
 
269 aa  50.4  3e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.15666e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>