More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0046 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
244 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 
238 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  55.42 
 
 
238 aa  252  4e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
246 aa  231  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  51.05 
 
 
245 aa  231  8e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 
242 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 
243 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  72.97 
 
 
105 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  30.42 
 
 
253 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 
261 aa  85.1  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
263 aa  84.7  1e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 
261 aa  85.1  1e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.74 
 
 
271 aa  84.7  1e-15  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
237 aa  83.6  2e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
252 aa  84.3  2e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 
261 aa  83.6  3e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 
257 aa  80.5  2e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3693  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.74 
 
 
241 aa  79  6e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4032  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.74 
 
 
241 aa  78.6  1e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  33.66 
 
 
244 aa  78.2  1e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
237 aa  78.6  1e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
249 aa  77.4  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3559  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.74 
 
 
241 aa  77.4  2e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 
278 aa  76.6  3e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
256 aa  76.6  3e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 
247 aa  76.6  3e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
254 aa  77  3e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  2.12772e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
256 aa  76.6  3e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
278 aa  76.6  4e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
249 aa  76.3  4e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  29.15 
 
 
263 aa  75.9  5e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
256 aa  75.9  6e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
256 aa  75.9  6e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 
255 aa  75.9  6e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  29.41 
 
 
251 aa  75.5  8e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 
238 aa  75.1  9e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  33.67 
 
 
256 aa  74.3  2e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
250 aa  74.3  2e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
256 aa  73.9  2e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 
241 aa  73.9  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.38 
 
 
252 aa  73.6  3e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.5866e-05  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  28.46 
 
 
285 aa  73.6  3e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.61 
 
 
256 aa  73.6  3e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 
243 aa  73.6  3e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 
270 aa  72.8  5e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
256 aa  72.8  5e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  30.86 
 
 
248 aa  72.4  6e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 
234 aa  72.4  7e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  42.22 
 
 
145 aa  72  8e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 
254 aa  71.6  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  31.16 
 
 
260 aa  71.2  1e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
249 aa  70.9  2e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.27927e-05  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.82 
 
 
240 aa  70.9  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 
249 aa  70.9  2e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 
259 aa  69.7  4e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
248 aa  69.7  4e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 
246 aa  69.7  4e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
256 aa  69.3  5e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
258 aa  69.3  5e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  30.45 
 
 
248 aa  69.3  5e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
243 aa  68.9  7e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
243 aa  68.9  7e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
243 aa  68.9  7e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
243 aa  68.9  7e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  27.75 
 
 
234 aa  68.6  8e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
269 aa  68.6  8e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
248 aa  68.6  8e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
262 aa  68.6  9e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  23.32 
 
 
225 aa  68.2  1e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
251 aa  68.2  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  29.46 
 
 
249 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
248 aa  67.8  1e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.85 
 
 
244 aa  68.2  1e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.85 
 
 
244 aa  68.2  1e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 
248 aa  67.8  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 
259 aa  68.2  1e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 
249 aa  67.8  2e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  27.14 
 
 
241 aa  67  2e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  23.71 
 
 
243 aa  67.4  2e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
242 aa  67.4  2e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  31.55 
 
 
255 aa  67.8  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
247 aa  67  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
241 aa  67  3e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.14 
 
 
245 aa  67  3e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
251 aa  67  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 
270 aa  67  3e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  29.36 
 
 
251 aa  66.6  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 
244 aa  67  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  32.88 
 
 
244 aa  66.6  3e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 
242 aa  66.2  4e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  28.04 
 
 
234 aa  66.6  4e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  29.79 
 
 
251 aa  66.2  4e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
270 aa  65.9  5e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
264 aa  66.2  5e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
238 aa  65.9  6e-10  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  1.3898e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
253 aa  65.5  7e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  28.75 
 
 
248 aa  65.5  7e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
248 aa  65.5  7e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>