111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0037 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
332 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  77.78 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  45.83 
 
 
258 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  55.95 
 
 
256 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1369  hypothetical protein  44.16 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0215137  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2073  CHAP domain containing protein  43.55 
 
 
344 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000221932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1988  hypothetical protein  44.17 
 
 
599 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  44.26 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.100822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  41.94 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5548  hypothetical protein  43.33 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352514  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.97 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.54 
 
 
160 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  33.96 
 
 
462 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  47.54 
 
 
2277 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.05 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  36.91 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2649  CHAP domain containing protein  37.93 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.112963 
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  36 
 
 
491 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.62 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.64 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  25.45 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  34.76 
 
 
383 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.33 
 
 
372 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.17 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.98 
 
 
225 aa  59.7  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.26 
 
 
170 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.14 
 
 
201 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  44.59 
 
 
227 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.19 
 
 
762 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  59.62 
 
 
225 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.03 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.08 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.24 
 
 
667 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  33.74 
 
 
383 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  32.26 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.25 
 
 
160 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0079  CHAP domain containing protein  33.62 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  50 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  30.29 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  46.05 
 
 
232 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.49 
 
 
306 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  30.77 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  38.96 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  29.75 
 
 
392 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2857  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  41.38 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  30.13 
 
 
454 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.57 
 
 
182 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.67 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  32.68 
 
 
450 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.9 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.38 
 
 
224 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.54 
 
 
283 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  28.48 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.84 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.59 
 
 
143 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  40.51 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  47.17 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.82 
 
 
554 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.48 
 
 
1089 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.31 
 
 
198 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.95 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  37.35 
 
 
739 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  27.71 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  37.35 
 
 
739 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  37.86 
 
 
239 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 
234 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  44.12 
 
 
285 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.47 
 
 
412 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  38.46 
 
 
1017 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  28.24 
 
 
395 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  32.26 
 
 
438 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1624  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.958016  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.33 
 
 
575 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  30.91 
 
 
381 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 
317 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
974 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0048  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlA  33.67 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0248425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.29 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3704  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3755  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  45.9 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.39 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.94 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.78 
 
 
487 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3969  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.28 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2852  hypothetical protein  34.67 
 
 
335 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  34.23 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.49 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.2 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.54 
 
 
531 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.81 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.51 
 
 
266 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  35.71 
 
 
228 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  32.54 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  28.03 
 
 
241 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  35.37 
 
 
234 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>