More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0025 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.12 
 
 
506 aa  645  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
515 aa  998  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  63.69 
 
 
487 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.94 
 
 
491 aa  584  1e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  62.9 
 
 
494 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.84 
 
 
491 aa  555  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.27 
 
 
517 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.37 
 
 
488 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.66 
 
 
518 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  58.98 
 
 
484 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.28 
 
 
507 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.84 
 
 
490 aa  516  1e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.84 
 
 
490 aa  516  1e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.85 
 
 
480 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  56.97 
 
 
502 aa  508  1e-142  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.96 
 
 
481 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  55.02 
 
 
488 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.49 
 
 
491 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  55.17 
 
 
493 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57 
 
 
479 aa  487  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.99 
 
 
463 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.67 
 
 
486 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.87 
 
 
498 aa  469  1e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.97 
 
 
521 aa  471  1e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.81 
 
 
484 aa  466  1e-130  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.94 
 
 
483 aa  446  1e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.92 
 
 
461 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.4 
 
 
475 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.2 
 
 
471 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.2 
 
 
471 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.2 
 
 
471 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.59 
 
 
470 aa  415  1e-115  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  52.44 
 
 
496 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.19 
 
 
470 aa  405  1e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.94 
 
 
465 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.24 
 
 
480 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.8 
 
 
496 aa  363  4e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  45.51 
 
 
456 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.07 
 
 
460 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.51 
 
 
456 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.51 
 
 
456 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.63 
 
 
442 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.33 
 
 
438 aa  297  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.65 
 
 
463 aa  297  4e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.03 
 
 
452 aa  296  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.22 
 
 
460 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.74491e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.62 
 
 
438 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.93 
 
 
440 aa  293  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.14 
 
 
433 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.18 
 
 
465 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.4 
 
 
471 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.49 
 
 
441 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.83 
 
 
437 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  38.92 
 
 
437 aa  277  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  38.62 
 
 
434 aa  273  5e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.49 
 
 
428 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.33126e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.08 
 
 
443 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  35.12 
 
 
444 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  1.30891e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.43 
 
 
461 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.27 
 
 
444 aa  267  3e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  4.12367e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.27 
 
 
444 aa  267  3e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  3.88996e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.27 
 
 
457 aa  267  3e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  37.16 
 
 
436 aa  266  7e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.77 
 
 
467 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.58 
 
 
442 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.90647e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  39.46 
 
 
429 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.68 
 
 
453 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1528  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.97 
 
 
440 aa  264  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000884717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.86 
 
 
436 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.88 
 
 
429 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.7248e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  39.04 
 
 
429 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.53 
 
 
441 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  37.27 
 
 
465 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1589  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.11 
 
 
434 aa  259  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.20476e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  37.37 
 
 
458 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  37.3 
 
 
465 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0847  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.14 
 
 
433 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132652  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.88 
 
 
435 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2917  hypothetical protein  37.78 
 
 
482 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.78 
 
 
443 aa  256  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.19 
 
 
451 aa  256  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.76 
 
 
433 aa  256  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.46 
 
 
441 aa  256  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  34.14 
 
 
473 aa  254  2e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.89 
 
 
446 aa  254  2e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.49 
 
 
429 aa  254  2e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  37.01 
 
 
428 aa  254  2e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0167  hypothetical protein  38.02 
 
 
458 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.31 
 
 
470 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3022  xanthine/uracil permease family protein  38.02 
 
 
458 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266672  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0462  xanthine/uracil permease family protein  38.02 
 
 
458 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.859148  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.9 
 
 
466 aa  254  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2977  hypothetical protein  38.02 
 
 
458 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2608  hypothetical protein  38.02 
 
 
458 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503637  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.04 
 
 
433 aa  254  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0980  hypothetical protein  38.02 
 
 
458 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.01 
 
 
448 aa  254  4e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.58 
 
 
436 aa  253  5e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.34 
 
 
433 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  34.31 
 
 
470 aa  253  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>