41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0020 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
132 aa  253  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  66.06 
 
 
110 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  62.39 
 
 
110 aa  138  2e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  63.89 
 
 
109 aa  137  4e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.41 
 
 
112 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  57.8 
 
 
110 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  56.88 
 
 
111 aa  119  2e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.85 
 
 
111 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  57.14 
 
 
110 aa  114  4e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  52.29 
 
 
117 aa  110  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 
277 aa  109  1e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  54.13 
 
 
114 aa  109  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  51.43 
 
 
130 aa  108  2e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  54.13 
 
 
114 aa  109  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  54.13 
 
 
114 aa  109  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  53.64 
 
 
111 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.88 
 
 
114 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  51.89 
 
 
110 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 
113 aa  102  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  51.89 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  49.54 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  46.23 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  47.62 
 
 
122 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  47.12 
 
 
113 aa  68.2  4e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  38.32 
 
 
144 aa  61.6  3e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40.45 
 
 
110 aa  60.8  6e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  43.62 
 
 
107 aa  58.5  3e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  41.84 
 
 
111 aa  57  8e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  36.11 
 
 
115 aa  53.5  9e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  42.03 
 
 
120 aa  50.1  9e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.14 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  35.21 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  27.08 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 
111 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  24.14 
 
 
219 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  35.56 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>