40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0018 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
199 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  60.38 
 
 
212 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
198 aa  162  4e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 
190 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
190 aa  110  1e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  5.56725e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
210 aa  91.3  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
191 aa  77.8  9e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  32.95 
 
 
188 aa  70.1  2e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  34.32 
 
 
193 aa  61.6  6e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 
205 aa  62  6e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 
178 aa  60.8  1e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 
221 aa  58.5  6e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
187 aa  58.2  7e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 
188 aa  58.2  8e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
202 aa  57  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 
180 aa  56.6  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
207 aa  56.2  3e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 
188 aa  55.1  8e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  30.99 
 
 
214 aa  54.3  1e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
207 aa  53.9  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
208 aa  53.1  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
208 aa  53.5  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  38.05 
 
 
189 aa  52.4  4e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  29.1 
 
 
199 aa  51.6  7e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 
195 aa  50.1  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 
190 aa  49.7  3e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
196 aa  49.7  3e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
207 aa  48.9  5e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
221 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 
225 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  32.82 
 
 
196 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  32.56 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.17 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 
204 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 
237 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>