More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0009 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
139 aa  281  2e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  83.82 
 
 
147 aa  231  2e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  82.58 
 
 
160 aa  228  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  78.26 
 
 
146 aa  224  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  78.26 
 
 
146 aa  224  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  78.26 
 
 
146 aa  224  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  86.29 
 
 
149 aa  224  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  86.78 
 
 
147 aa  221  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  81.48 
 
 
150 aa  220  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  78.63 
 
 
143 aa  216  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  77.1 
 
 
148 aa  216  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  83.06 
 
 
153 aa  214  3e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  81.82 
 
 
147 aa  212  1e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  80.47 
 
 
148 aa  211  2e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.33249e-05  hitchhiker  1.48724e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  77.86 
 
 
147 aa  211  3e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  74.45 
 
 
156 aa  209  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  76.92 
 
 
151 aa  206  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  80.77 
 
 
156 aa  206  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  84.09 
 
 
144 aa  205  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  79.7 
 
 
147 aa  197  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  81.3 
 
 
148 aa  196  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  66.67 
 
 
141 aa  184  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  68.18 
 
 
145 aa  181  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  73.28 
 
 
155 aa  179  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  73.39 
 
 
134 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  59.12 
 
 
144 aa  159  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  62.99 
 
 
154 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  87.36 
 
 
144 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  62.16 
 
 
150 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  48.78 
 
 
150 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  53.04 
 
 
142 aa  116  8e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  51.18 
 
 
145 aa  115  2e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 
150 aa  110  7e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 
150 aa  110  7e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 
150 aa  110  7e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
148 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  43.51 
 
 
140 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  50.43 
 
 
157 aa  107  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.8 
 
 
164 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  43.8 
 
 
144 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  44.63 
 
 
144 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  49.11 
 
 
168 aa  103  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  48.31 
 
 
158 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  40.97 
 
 
176 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
168 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  52 
 
 
162 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 
153 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  45.1 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 
182 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 
204 aa  82.4  2e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 
306 aa  81.3  5e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 
322 aa  79.3  1e-14  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.27 
 
 
250 aa  79  2e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 
299 aa  79  2e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
281 aa  79  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  3.76127e-05 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 
134 aa  79  2e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 
255 aa  77  7e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
112 aa  77  7e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 
327 aa  76.6  9e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
292 aa  76.3  1e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
133 aa  76.6  1e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 
513 aa  76.6  1e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 
287 aa  75.5  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 
250 aa  75.1  3e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 
331 aa  74.7  4e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  36.79 
 
 
287 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  36.79 
 
 
301 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  6.88741e-11  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 
291 aa  73.6  8e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
296 aa  73.6  9e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 
291 aa  72.8  1e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
316 aa  73.2  1e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
291 aa  72.8  1e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  37.74 
 
 
304 aa  73.2  1e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
293 aa  73.2  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
291 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 
292 aa  72.8  2e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 
286 aa  72  2e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
320 aa  72.4  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 
265 aa  72  2e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
311 aa  71.6  3e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 
340 aa  71.2  4e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 
300 aa  71.2  4e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
301 aa  71.2  4e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
311 aa  70.9  5e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
311 aa  70.9  5e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
301 aa  70.5  7e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 
304 aa  70.5  7e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
261 aa  70.5  7e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
311 aa  70.5  7e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  35.29 
 
 
274 aa  70.5  8e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.53171e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
301 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 
298 aa  70.5  8e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 
296 aa  70.5  8e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
291 aa  70.1  9e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 
305 aa  69.7  1e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.78 
 
 
255 aa  69.7  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>