63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0005 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
179 aa  347  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  63.45 
 
 
183 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  62.59 
 
 
206 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  47.67 
 
 
173 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  45.61 
 
 
188 aa  116  2e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  51.04 
 
 
201 aa  109  2e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  55.32 
 
 
217 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  50 
 
 
198 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  39.88 
 
 
196 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  35.47 
 
 
190 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  35.47 
 
 
190 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  35.47 
 
 
190 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.8 
 
 
196 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  40.52 
 
 
187 aa  99  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  34.66 
 
 
188 aa  99  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  35.84 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  51.06 
 
 
117 aa  97.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  45.79 
 
 
134 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  46 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  34.52 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  47.17 
 
 
273 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  47.37 
 
 
177 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  40.62 
 
 
166 aa  90.9  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  44.44 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  44.68 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.12 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  41.9 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  41.12 
 
 
188 aa  81.6  6e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  45.1 
 
 
143 aa  81.3  7e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  36.54 
 
 
180 aa  79  3e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  49.47 
 
 
171 aa  78.6  4e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.79 
 
 
217 aa  78.2  5e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  40.95 
 
 
207 aa  77.8  8e-14  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  39.25 
 
 
171 aa  75.1  5e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.67 
 
 
266 aa  71.2  7e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  67.4  1e-10  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  35.51 
 
 
184 aa  65.9  3e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  30.53 
 
 
156 aa  64.3  1e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  32.95 
 
 
155 aa  57.8  9e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.65832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  32.63 
 
 
159 aa  54.7  7e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  34.33 
 
 
101 aa  54.3  9e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.93 
 
 
153 aa  53.9  1e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  30.93 
 
 
151 aa  54.3  1e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  38.18 
 
 
149 aa  52.4  3e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  29.85 
 
 
101 aa  51.6  6e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  35.38 
 
 
152 aa  51.2  8e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  27.27 
 
 
160 aa  51.2  8e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  29.79 
 
 
97 aa  50.8  1e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  31.46 
 
 
97 aa  50.4  1e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  23.81 
 
 
300 aa  50.4  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  29.23 
 
 
286 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  31 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  29.49 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2033  protein of unknown function DUF1159  34.25 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0187777  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  30.84 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  27.94 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  40.68 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  31.65 
 
 
170 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  29.03 
 
 
266 aa  41.6  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2053  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113901  normal  0.0119007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0041  protein of unknown function DUF721  28.07 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.379722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  22.34 
 
 
97 aa  41.2  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>