More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_R0019 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_R0018  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.50415e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0019  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.61246e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4253  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.87819e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0062  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t13  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t52  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA11  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00000000654973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA23  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R72  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564318  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R83  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115902  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1400  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0063  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0018  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0080  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4250  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4226  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4252  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000173353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4251  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000189937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2736  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000214586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0049  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000590411  decreased coverage  0.00000280751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0065  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0064  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00015  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000191141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000893076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0031  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0056  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000193092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0013  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671128  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0880  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000131793  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2611  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000669523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0819  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  normal  0.860753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0818  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0005423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0028  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0073  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000862266  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0019  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0039  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.722493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0040  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.710582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0056  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000735522  normal  0.906339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0006  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0065  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.448477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000928863  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0814  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000653999  normal  0.868526 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0025  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.469225  normal  0.082047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0039  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  0.700265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0023  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483776  normal  0.0816799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0054  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0055  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000306269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0056  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000278009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0057  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000124727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0058  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000115493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0059  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000128133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0878  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal  0.655098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0063  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807703  normal  0.539027 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0030  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0084  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0065  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000203658  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0032  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0037  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000000657367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0038  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000622929  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>