212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2170 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
94 aa  182  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.56588e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  87.23 
 
 
95 aa  163  7e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  2.2409e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  65.96 
 
 
94 aa  131  4e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  76.74 
 
 
84 aa  128  2e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  76.74 
 
 
84 aa  128  2e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2874  F0F1 ATP synthase subunit C  53.26 
 
 
95 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.629267  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0007  F0F1 ATP synthase subunit C  53.25 
 
 
81 aa  81.6  3e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.316069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3310  F0F1 ATP synthase subunit C  49.4 
 
 
89 aa  81.3  4e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  53.95 
 
 
84 aa  80.9  6e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  53.95 
 
 
84 aa  80.9  6e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.13686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  52.63 
 
 
85 aa  79.7  1e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  45.35 
 
 
91 aa  78.2  4e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  45.35 
 
 
91 aa  78.2  4e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3289  ATP synthase F0, C subunit  48.84 
 
 
82 aa  77  7e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.524691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
85 aa  76.3  1e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4109  ATP synthase F0, C subunit  44.05 
 
 
86 aa  76.3  1e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.10329e-14  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  48.15 
 
 
85 aa  76.3  1e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  49.37 
 
 
85 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5205  F0F1 ATP synthase subunit C  49.37 
 
 
85 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158761  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5300  F0F1 ATP synthase subunit C  49.37 
 
 
85 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371709  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73300  F0F1 ATP synthase subunit C  49.37 
 
 
85 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.731054  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5436  F0F1 ATP synthase subunit C  49.37 
 
 
85 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5418  F0F1 ATP synthase subunit C  49.37 
 
 
85 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.000148826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  49.37 
 
 
85 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  48.68 
 
 
85 aa  74.3  5e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.05757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  47.37 
 
 
85 aa  73.9  6e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.28569e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3735  F0F1 ATP synthase subunit C  45.12 
 
 
85 aa  73.9  6e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246424  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2435  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
95 aa  73.6  8e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4467  F0F1 ATP synthase subunit C  47.44 
 
 
85 aa  72.8  1e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  5.00836e-05  hitchhiker  1.17641e-09 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  43.68 
 
 
100 aa  72  3e-12  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  43.68 
 
 
100 aa  72  3e-12  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3961  F0F1 ATP synthase subunit C  47.95 
 
 
84 aa  71.2  5e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.418687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3757  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  71.2  5e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3649  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
83 aa  70.1  9e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.88902e-06  unclonable  6.52587e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4135  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.0467e-05  hitchhiker  0.00469633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4315  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0295154  hitchhiker  6.18272e-11 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  46.91 
 
 
83 aa  69.7  1e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  4.7604e-06 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0305  F0F1 ATP synthase subunit C  41.86 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.26733e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4050  F0F1 ATP synthase subunit C  46.91 
 
 
83 aa  69.7  1e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4752  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4903  F0F1 ATP synthase subunit C  46.91 
 
 
83 aa  69.7  1e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  8.64371e-08  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  46.91 
 
 
83 aa  69.7  1e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  2.55174e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4371  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.50209e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4022  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0586605  normal  0.864238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4512  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00265019  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4370  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
83 aa  70.1  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00324113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  45.95 
 
 
82 aa  69.3  2e-11  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.4823e-07  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  45.95 
 
 
82 aa  69.3  2e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  5.0881e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2749  F0F1 ATP synthase subunit C  41.46 
 
 
90 aa  67.4  7e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  3.57567e-05  normal  0.274405 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  45.83 
 
 
81 aa  66.6  1e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3971  F0F1 ATP synthase subunit C  45.57 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000527403  normal  0.270101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  62  2e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  45.21 
 
 
82 aa  61.6  3e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  44.87 
 
 
89 aa  62  3e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  45.21 
 
 
82 aa  62  3e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 
76 aa  61.2  5e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
82 aa  61.2  5e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
82 aa  60.8  6e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
82 aa  60.5  7e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
82 aa  60.5  7e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
82 aa  60.5  7e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  39.74 
 
 
87 aa  59.7  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  42.67 
 
 
82 aa  60.1  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
81 aa  58.9  2e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.62288e-05  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 
73 aa  58.5  3e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1701  F0F1 ATP synthase subunit C  45.12 
 
 
84 aa  58.2  3e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.156279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  55.32 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  51.61 
 
 
72 aa  58.5  3e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  51.47 
 
 
70 aa  58.2  4e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  51.47 
 
 
70 aa  58.2  4e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4612  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 
75 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  51.47 
 
 
70 aa  58.2  4e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
79 aa  57.8  5e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 
79 aa  56.6  1e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  44.59 
 
 
78 aa  56.2  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  42.65 
 
 
70 aa  56.2  1e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0367  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 
79 aa  54.7  4e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52210  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 
78 aa  53.9  7e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  54 
 
 
77 aa  53.5  1e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  48.15 
 
 
77 aa  53.1  1e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3516  F0F1 ATP synthase subunit C  41.11 
 
 
101 aa  52.4  2e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.599302  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  37.66 
 
 
88 aa  51.6  3e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  37.35 
 
 
89 aa  51.2  5e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3531  F0F1 ATP synthase subunit C  49.12 
 
 
82 aa  51.2  5e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0499158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  37.66 
 
 
88 aa  51.2  5e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.29893e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2592  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 
78 aa  50.4  7e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.130399  normal  0.0749616 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  41.82 
 
 
82 aa  50.4  7e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  37.97 
 
 
100 aa  50.4  8e-06  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3899  F0F1 ATP synthase subunit C  44.05 
 
 
89 aa  50.4  9e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>