95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2123 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  39.68 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1216  putative HTH-type transcriptional regulator  34.92 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3005  DNA-binding protein  29.69 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0630  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.054738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3038  DNA-binding protein  28.12 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3003  DNA-binding protein  28.12 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0902628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2791  DNA-binding protein  28.12 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0381729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2236  DNA-binding protein  28.12 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.972034  hitchhiker  0.0000000327322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2740  Cro/CI family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.29378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3001  DNA-binding protein  28.12 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000935469 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2721  Cro/CI family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3040  DNA-binding protein  29.69 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.119109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2804  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4332  helix-turn-helix type 3  34.38 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3255  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 262 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1951  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0335085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2183  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3642  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182949  normal  0.278552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0314  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203005  normal  0.441895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0937  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.792674  normal  0.0631359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0997  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0918  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3364  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0418  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3417  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3550  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3598  helix-turn-helix type 3  35.38 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4481  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0816  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2870  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000158683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1687  helix-turn-helix type 3  29.69 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0466  hypothetical protein  29.69 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0490  hypothetical protein  29.69 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4792  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0662158  normal  0.716445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0484  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0086  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.417163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1695  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0597679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05360  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  33.33 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5760  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205139  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3131  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94784  normal  0.842689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3870  transcriptional regulator, XRE family protein  31.67 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1037  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2209  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  26.67 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0375  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4238  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0478  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0218  transcription regulator, Cro/CI family -related protein  26.98 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  28.57 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5039  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1757  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  28.57 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4401  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0788  transcriptional regulator, Cro/CI family  30 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2194  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 72 aa  42  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0168  XRE family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  28.17 
 
 		 90 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3478  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 76 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0540861  normal  0.173042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28080  putative transcriptional regulator  27.69 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00426893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0924  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 77 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.385099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2169  hypothetical protein  27.87 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0666173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2300  putative transcriptional regulatory protein  27.87 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2988  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.962229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3592  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3882  XRE family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2718  putative transcriptional regulator  27.87 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.973938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1322  hypothetical protein  26.67 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117292  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4120  transcriptional regulator, XRE family  26.87 
 
 		 80 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1981  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 68 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>