85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2105 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  100 
 
 		 315 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  39.48 
 
 		 407 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  41.53 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  39.63 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  39.34 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  33.81 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  36.1 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  34.16 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  34.16 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 728 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.48 
 
 		 726 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  37.34 
 
 		 675 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  35.22 
 
 		 773 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  36.89 
 
 		 675 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.74 
 
 		 699 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  34.98 
 
 		 698 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  34.85 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  35.27 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.4 
 
 		 689 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  35.62 
 
 		 721 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  32.92 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  32.5 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  32.5 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  35.62 
 
 		 694 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 669 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  35.62 
 
 		 721 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  32.07 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  32.07 
 
 		 357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  30.1 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  33.86 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  33.2 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  34.76 
 
 		 708 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  34.54 
 
 		 712 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 355 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  34.17 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  29.39 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  29.15 
 
 		 355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  29.45 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  30.87 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 691 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  30.07 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  30.54 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  31.31 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  31.23 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  27.64 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  29.17 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  32.28 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  26.96 
 
 		 331 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  28.81 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  31.35 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  33.05 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  29.96 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  28.73 
 
 		 350 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  27.42 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  29.76 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  29.39 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  29.39 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  27.15 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  40.34 
 
 		 181 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  31.88 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  27.96 
 
 		 671 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  26.46 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  26.64 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  26.64 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  26.64 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  39 
 
 		 130 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  23.53 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  41.86 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  25.08 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  49.28 
 
 		 79 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  33.33 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.63 
 
 		 126 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  30.21 
 
 		 145 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  23.35 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  27.22 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  31.52 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  59.26 
 
 		 461 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  25.58 
 
 		 211 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>