More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2056 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  44.33 
 
 		 817 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  42.11 
 
 		 843 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  45.71 
 
 		 830 aa  693    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  44.75 
 
 		 799 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  42.48 
 
 		 839 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  43.32 
 
 		 814 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  44.27 
 
 		 846 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  46.41 
 
 		 794 aa  706    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  46.64 
 
 		 794 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 		 814 aa  678    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  43.27 
 
 		 825 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.06 
 
 		 817 aa  754    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  48.91 
 
 		 814 aa  740    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  44.58 
 
 		 815 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  45.75 
 
 		 803 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  44.72 
 
 		 817 aa  700    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  47.97 
 
 		 814 aa  749    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  42 
 
 		 849 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 804 aa  1666    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  42.91 
 
 		 823 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  44.33 
 
 		 817 aa  693    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  43.05 
 
 		 861 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  49.03 
 
 		 793 aa  730    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  49.16 
 
 		 793 aa  733    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  48.71 
 
 		 846 aa  753    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  44.08 
 
 		 817 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  45.23 
 
 		 799 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  42.54 
 
 		 823 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  42.46 
 
 		 847 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  44.79 
 
 		 819 aa  691    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  41.49 
 
 		 832 aa  641    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  48.06 
 
 		 803 aa  692    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  43.02 
 
 		 851 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  41.49 
 
 		 855 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  44.85 
 
 		 846 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  48.82 
 
 		 800 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  47.69 
 
 		 790 aa  669    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  42.03 
 
 		 844 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  42.03 
 
 		 844 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00516  bifunctional murein transglycosylase/transpeptidase  40.16 
 
 		 887 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  42.98 
 
 		 852 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  42.03 
 
 		 844 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  42.39 
 
 		 822 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  41.69 
 
 		 851 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  41.59 
 
 		 835 aa  631  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  43.73 
 
 		 791 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  41.76 
 
 		 865 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  42.47 
 
 		 839 aa  629  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  42.24 
 
 		 839 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  43.98 
 
 		 796 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  40.78 
 
 		 851 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  40.78 
 
 		 851 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  42.11 
 
 		 839 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  42.24 
 
 		 839 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  40.78 
 
 		 851 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  41.61 
 
 		 850 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  43.94 
 
 		 797 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  41.49 
 
 		 850 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  41.91 
 
 		 839 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  41.49 
 
 		 850 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  41.49 
 
 		 850 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  40.54 
 
 		 852 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  42.76 
 
 		 777 aa  622  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  41.37 
 
 		 850 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  43.43 
 
 		 807 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0369  penicillin-binding protein, 1A family protein  41.09 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0358767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  40.87 
 
 		 850 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  40.87 
 
 		 850 aa  618  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  40.75 
 
 		 850 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  40.87 
 
 		 858 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  43.4 
 
 		 797 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  40.75 
 
 		 850 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  40.87 
 
 		 850 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  43.53 
 
 		 797 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  40.68 
 
 		 850 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  40.87 
 
 		 850 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  40.87 
 
 		 850 aa  618  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  43.67 
 
 		 797 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  43.22 
 
 		 797 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  42.82 
 
 		 795 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  43.26 
 
 		 796 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  42.54 
 
 		 836 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  42.54 
 
 		 833 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  40.39 
 
 		 863 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  41.4 
 
 		 851 aa  612  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  43.05 
 
 		 786 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  44.8 
 
 		 797 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  41.53 
 
 		 868 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  42.26 
 
 		 852 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  43.09 
 
 		 793 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  44.8 
 
 		 797 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  44.8 
 
 		 797 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  42.65 
 
 		 840 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  44.8 
 
 		 770 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  44.8 
 
 		 797 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  42.13 
 
 		 846 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  44.66 
 
 		 797 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  44.66 
 
 		 797 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  42.13 
 
 		 840 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  42.13 
 
 		 840 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>