More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2047 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  100 
 
 		 294 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  29.12 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  30.51 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  29.07 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  29.77 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  31.64 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  29.3 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  29.37 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  32.42 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  30.8 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  31.4 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  28.92 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  29.89 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.21 
 
 		 610 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  28.14 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  28.03 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  29.1 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  29.54 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  29.55 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  29.85 
 
 		 613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  26.95 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  29.41 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.96 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  27.37 
 
 		 288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  30.83 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  30.83 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  28.93 
 
 		 477 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  30.4 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  28.52 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.52 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.52 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  28.52 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.57 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  26.91 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.21 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.21 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  27.21 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.21 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.21 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  27.21 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  27.48 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.21 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  27.41 
 
 		 647 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.62 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  27.52 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  27.64 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  28.16 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  28.04 
 
 		 419 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  28.35 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.84 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  28.57 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  27.27 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  29.92 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  27.48 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0587  rhodanese domain-containing protein  29.34 
 
 		 251 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287178  normal  0.0572789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.97 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  27.27 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.6 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  28.24 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  26.62 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  26.05 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  28.24 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  25.46 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  27.6 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  27.86 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  27.86 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  24.45 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  26.52 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  28.24 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  29.23 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  28.36 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 362 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.2 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  28.63 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  27.24 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2054  Rhodanese domain protein  25.91 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0105049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  27.61 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  28.63 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  25.91 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>