More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2014 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_2014  chaperone DnaJ-like  100 
 
 
316 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  51.72 
 
 
341 aa  325  8.000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  51.72 
 
 
313 aa  324  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  47.5 
 
 
315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  47.22 
 
 
327 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  46.11 
 
 
313 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2956  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.12 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  50.32 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  49.53 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2220  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.83 
 
 
325 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159655  normal  0.021204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  48.12 
 
 
313 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1428  heat shock protein DnaJ-like protein  48.9 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.65 
 
 
315 aa  272  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  45.2 
 
 
315 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  44.03 
 
 
313 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.23 
 
 
323 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6288  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.69 
 
 
313 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  52.91 
 
 
328 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.83 
 
 
317 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.12 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0490  heat shock protein DnaJ-like  47.35 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  48 
 
 
324 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.45 
 
 
324 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1124  heat shock protein DnaJ domain protein  46.99 
 
 
326 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.405615 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  44.48 
 
 
324 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  47.37 
 
 
315 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0723  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.39 
 
 
326 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1431  heat shock protein DnaJ family  47.65 
 
 
318 aa  249  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  42.2 
 
 
320 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2478  heat shock protein DnaJ domain protein  48.9 
 
 
304 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  48.61 
 
 
319 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  48.61 
 
 
319 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.58 
 
 
319 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  48.6 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  44.04 
 
 
330 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0285  chaperone DnaJ domain protein  48.3 
 
 
319 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  47.98 
 
 
296 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  44.69 
 
 
314 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  49.21 
 
 
310 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  49.21 
 
 
310 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4897  curved-DNA-binding protein  45 
 
 
314 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  46.13 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  39.38 
 
 
306 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  39.06 
 
 
306 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.49 
 
 
323 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3374  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.94 
 
 
347 aa  228  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4905  chaperone DnaJ domain-containing protein  47.52 
 
 
318 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  38.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  38.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  38.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  38.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  38.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  38.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  38.44 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  38.12 
 
 
306 aa  225  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0577  chaperone DnaJ-like  46.58 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344875  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  40.57 
 
 
313 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3019  heat shock protein DnaJ domain protein  45.25 
 
 
295 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.493396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  42.41 
 
 
320 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3860  curved DNA-binding protein CbpA  41.25 
 
 
309 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.167572  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2984  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.41 
 
 
331 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0049  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
339 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.3 
 
 
319 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.51 
 
 
289 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  38.7 
 
 
314 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  35.94 
 
 
335 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  35.94 
 
 
335 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  38.01 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  34.23 
 
 
370 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1171  chaperone DnaJ-like  38.92 
 
 
304 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  38.51 
 
 
336 aa  198  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.61 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1130  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.55 
 
 
351 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0647  chaperone DnaJ domain protein  39.65 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0618  heat shock protein DnaJ domain protein  39.08 
 
 
331 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0047  heat shock protein DnaJ-like  38.89 
 
 
330 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.940459  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0639  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.08 
 
 
331 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  35.45 
 
 
339 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1207  heat shock protein DnaJ  39.22 
 
 
323 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.480945 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1003  heat shock protein DnaJ domain protein  38.65 
 
 
311 aa  192  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  34.49 
 
 
375 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  36.11 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  34.41 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  35.11 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  34.76 
 
 
378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  37.24 
 
 
335 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.46 
 
 
301 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  35.52 
 
 
376 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  41.14 
 
 
298 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  34.93 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.74 
 
 
326 aa  188  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  41.14 
 
 
294 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.31 
 
 
315 aa  188  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  35.53 
 
 
335 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  37.86 
 
 
287 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>