32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2005 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0095  Domain of unknown function DUF1791  49.69 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.921438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  51.45 
 
 		 176 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  45 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  34.85 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  31.48 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  33.73 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  34.09 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0504  hypothetical protein  26.81 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  32.28 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  30.3 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  26.92 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  30.92 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  29.03 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  21.19 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  25.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  25.69 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  31.3 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  29.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  32.28 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  28.66 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  42.62 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  31.34 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  23.29 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1760  Domain of unknown function DUF1791  26.15 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289316  normal  0.172768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  21.64 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  23.85 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  25.19 
 
 		 151 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  25.55 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  32.09 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  24.44 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>