21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1961 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  29.13 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  29.46 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  26.35 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  28.39 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  29.46 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  28.89 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  27.56 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  26.8 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  29.13 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  26.47 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  27.78 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2421  hypothetical protein  23.49 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000019522  hitchhiker  0.0000597978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0343  hypothetical protein  26.13 
 
 		 260 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  25.69 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  22.67 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  23.13 
 
 		 159 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  23.13 
 
 		 159 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  27.96 
 
 		 267 aa  42  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  23.13 
 
 		 159 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>