235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1956 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 521 aa  1085    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  58.99 
 
 		 509 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  56.64 
 
 		 519 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 		 511 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  55.29 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  55.29 
 
 		 515 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  55.29 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  55.49 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  55.13 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  55.29 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  55.21 
 
 		 516 aa  568  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  54.74 
 
 		 512 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  53.62 
 
 		 517 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  55.49 
 
 		 511 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  56.67 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  55.08 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  55.15 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  55.36 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  55.15 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  54.09 
 
 		 514 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 		 514 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  54.09 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  55.15 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 		 508 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  55.15 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  54.09 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  53.76 
 
 		 519 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 		 515 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  55.15 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  55.15 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  55.15 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  55.01 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  54.09 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  54.09 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 		 515 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  54.22 
 
 		 515 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  53.76 
 
 		 519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  55.15 
 
 		 514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  54.51 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  54 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 		 514 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  55.47 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 		 514 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  54.79 
 
 		 510 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 		 529 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  54.97 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  54.03 
 
 		 514 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  55.17 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  54.6 
 
 		 514 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 		 513 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  54.9 
 
 		 513 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  53.5 
 
 		 514 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  54.22 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  54.19 
 
 		 512 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  54.02 
 
 		 517 aa  551  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  53.97 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  55.27 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 		 514 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  53.01 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  54.17 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  55.27 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  53.53 
 
 		 517 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  53.55 
 
 		 516 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  53.5 
 
 		 530 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  52.98 
 
 		 552 aa  534  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  51.74 
 
 		 520 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  53.02 
 
 		 505 aa  528  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  52.33 
 
 		 518 aa  527  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 		 509 aa  528  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.58 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 511 aa  523  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  51.55 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 		 515 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  52.98 
 
 		 552 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 		 525 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  50.58 
 
 		 516 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  50.48 
 
 		 511 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  50.87 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 521 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  48.54 
 
 		 514 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 514 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 506 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>