27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1922 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  344  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  32.23 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  31.29 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  27.86 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  29.63 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  27.46 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1577  hypothetical protein  25.38 
 
 		 130 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1337  FixH family protein  29.52 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  26.76 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2080  hypothetical protein  27.1 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  26.06 
 
 		 150 aa  47.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0782  hypothetical protein  32.97 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0323619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1235  hypothetical protein  27.62 
 
 		 266 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2426  hypothetical protein  23.85 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0117545  hitchhiker  0.0000688315 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1368  hypothetical protein  26.61 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.963563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1175  hypothetical protein  24 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2009  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000579412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  28.12 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2213  hypothetical protein  23.19 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000117467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1970  hypothetical protein  22.76 
 
 		 161 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000508823  hitchhiker  0.00854934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  27.08 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  27.08 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2005  hypothetical protein  22.76 
 
 		 161 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00021351  hitchhiker  0.000000141582 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  24.74 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  26.83 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000155714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2210  hypothetical protein  27.27 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>