299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1891 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1523  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
686 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0570  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
686 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0676435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5217  polyphosphate kinase  53.39 
 
 
727 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2072  polyphosphate kinase  52.67 
 
 
698 aa  717    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1954  polyphosphate kinase  57.76 
 
 
714 aa  794    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1536  polyphosphate kinase  51.46 
 
 
737 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.753907 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0581  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
686 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  51.95 
 
 
740 aa  725    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  53.1 
 
 
736 aa  742    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1196  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
687 aa  742    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.905186 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0788  polyphosphate kinase  52.29 
 
 
747 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0367  polyphosphate kinase  48.53 
 
 
690 aa  678    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0342  polyphosphate kinase  48.53 
 
 
690 aa  677    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0293  polyphosphate kinase  53.1 
 
 
736 aa  742    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587518  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1647  polyphosphate kinase  52.17 
 
 
765 aa  725    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0834113  hitchhiker  0.000217098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  55.93 
 
 
693 aa  785    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2161  polyphosphate kinase  52.67 
 
 
720 aa  720    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2160  polyphosphate kinase  52.34 
 
 
694 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5842  polyphosphate kinase  54.8 
 
 
712 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1085  polyphosphate kinase  54.69 
 
 
688 aa  781    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2019  polyphosphate kinase  52.04 
 
 
723 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279845  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1626  polyphosphate kinase  52.29 
 
 
747 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2388  polyphosphate kinase  57.97 
 
 
690 aa  815    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5464  polyphosphate kinase  52.81 
 
 
741 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335851  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02495  polyphosphate kinase  53.31 
 
 
700 aa  711    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4450  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
753 aa  742    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246923  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1891  polyphosphate kinase  100 
 
 
703 aa  1456    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5278  polyphosphate kinase  53.54 
 
 
747 aa  754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  53.54 
 
 
736 aa  749    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  54.09 
 
 
691 aa  775    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  52.81 
 
 
739 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2766  polyphosphate kinase  52.72 
 
 
747 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1711  polyphosphate kinase  52.04 
 
 
736 aa  709    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00451534  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0944  Polyphosphate kinase  56.71 
 
 
690 aa  813    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135403  normal  0.090034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3654  polyphosphate kinase  52.87 
 
 
702 aa  717    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0555564  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0822  polyphosphate kinase  54.48 
 
 
695 aa  712    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0132  polyphosphate kinase  54.09 
 
 
693 aa  775    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1273  polyphosphate kinase  52.65 
 
 
687 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822681  normal  0.156597 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1551  Polyphosphate kinase  51.29 
 
 
701 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.603175  hitchhiker  0.000343702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0590  polyphosphate kinase  52.69 
 
 
733 aa  735    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0330853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1882  polyphosphate kinase  52.6 
 
 
762 aa  724    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2178  polyphosphate kinase  51.74 
 
 
693 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.539931  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0214  polyphosphate kinase  58.07 
 
 
694 aa  820    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  54.05 
 
 
775 aa  771    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0890  polyphosphate kinase  52.56 
 
 
687 aa  734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2013  polyphosphate kinase  52.79 
 
 
687 aa  743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1870  polyphosphate kinase  59.18 
 
 
694 aa  804    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1876  polyphosphate kinase  51.29 
 
 
701 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1184  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
687 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  53.39 
 
 
736 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0300  polyphosphate kinase  52.59 
 
 
727 aa  733    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1307  polyphosphate kinase  52.36 
 
 
687 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0266  Polyphosphate kinase  55.14 
 
 
691 aa  736    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1299  polyphosphate kinase  52.29 
 
 
759 aa  738    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.561572  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1278  polyphosphate kinase  52.36 
 
 
687 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  57.96 
 
 
693 aa  823    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  53.54 
 
 
746 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1492  polyphosphate kinase  52.93 
 
 
686 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.352325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2851  polyphosphate kinase  52.65 
 
 
687 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2279  polyphosphate kinase  54.71 
 
 
693 aa  783    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5126  polyphosphate kinase  53.39 
 
 
747 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3577  polyphosphate kinase  54.45 
 
 
712 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3601  polyphosphate kinase  45.61 
 
 
686 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.487429 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  45.78 
 
 
727 aa  605  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2246  polyphosphate kinase  45.52 
 
 
703 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427679  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2306  polyphosphate kinase  45.85 
 
 
772 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1480  polyphosphate kinase  45.1 
 
 
723 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2622  polyphosphate kinase  45.86 
 
 
734 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.494843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2378  polyphosphate kinase  45.24 
 
 
723 aa  592  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2212  polyphosphate kinase  44.64 
 
 
701 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.729253  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3008  polyphosphate kinase  45.99 
 
 
698 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235985  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2017  polyphosphate kinase  43.73 
 
 
700 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1296  polyphosphate kinase  44.6 
 
 
717 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1035  polyphosphate kinase  43.37 
 
 
713 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988005  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4920  polyphosphate kinase  43.6 
 
 
816 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268776  normal  0.200111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  44.67 
 
 
722 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  44.67 
 
 
722 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0826  polyphosphate kinase  51.1 
 
 
766 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  43.87 
 
 
710 aa  548  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  42.43 
 
 
708 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  41.39 
 
 
745 aa  540  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  41.46 
 
 
708 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  41.08 
 
 
744 aa  541  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  41.44 
 
 
720 aa  535  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  43.87 
 
 
714 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  42.63 
 
 
721 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  42.24 
 
 
700 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  42.8 
 
 
736 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  41.74 
 
 
731 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  39.72 
 
 
762 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  41.35 
 
 
726 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  43.04 
 
 
705 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  41.87 
 
 
731 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  41.99 
 
 
712 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  41.37 
 
 
720 aa  524  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  42.61 
 
 
721 aa  525  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2235  Polyphosphate kinase  40.25 
 
 
766 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.640324  normal  0.28933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  41.44 
 
 
702 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  42.24 
 
 
709 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2492  polyphosphate kinase  41.52 
 
 
733 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>