204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1870 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1870  permease  100 
 
 		 319 aa  631  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  51.89 
 
 		 322 aa  338  9e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  49.39 
 
 		 335 aa  325  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  52.2 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  50.46 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  49.85 
 
 		 331 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  50.15 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  49.54 
 
 		 331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  46.34 
 
 		 332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  49.85 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  50.79 
 
 		 331 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  49.85 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  46.93 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  46.93 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  49.68 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  49.53 
 
 		 351 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  48.41 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  46.01 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  48.87 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  45.59 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  47.62 
 
 		 352 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  47.2 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  45.54 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  46.56 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  44.76 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  46.54 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  45.77 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  45.26 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  45.65 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  50.32 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  46.77 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  46.33 
 
 		 330 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  44.55 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  44.3 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  44.15 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  48.28 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  47.01 
 
 		 371 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  44.3 
 
 		 350 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  44.83 
 
 		 319 aa  278  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  46.18 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  47.73 
 
 		 353 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  49.03 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  49.35 
 
 		 351 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  46.28 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  43.09 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  46.08 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  45.6 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  46.41 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  45.08 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  42.39 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  42.68 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  44.9 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  44.59 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  43.04 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  43.45 
 
 		 349 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  47.34 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  44.59 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  46.08 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  42.59 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  46.28 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  44.27 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  46.35 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  47.73 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  45.91 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  47.48 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  44.83 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  46.01 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  45.33 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  38.21 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  39.35 
 
 		 334 aa  245  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  47.06 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  41.08 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  43.49 
 
 		 370 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  43.23 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  41.59 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  43.63 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  37.38 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  45.57 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  45.57 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  39.42 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  39.62 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  38.03 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  34.75 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  37.14 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  37.58 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  38.46 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  34.27 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  31.29 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  30.03 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  33.08 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  27.59 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  27.18 
 
 		 296 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  29.55 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  28.52 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  27.94 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  28.44 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  27.94 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  27.94 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  27.6 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>