More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1816 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  100 
 
 
255 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  58.2 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  54.33 
 
 
255 aa  293  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  55.29 
 
 
256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  49.02 
 
 
255 aa  271  7e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  46.06 
 
 
252 aa  223  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  43.48 
 
 
254 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  43.43 
 
 
252 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  44.49 
 
 
258 aa  217  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  41.9 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  45.02 
 
 
267 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  45.02 
 
 
267 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  45.12 
 
 
267 aa  202  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  42.97 
 
 
258 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  40.31 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  41.38 
 
 
268 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  41.67 
 
 
269 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  41.76 
 
 
286 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.14 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.3 
 
 
274 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  40.55 
 
 
306 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  41 
 
 
274 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.11 
 
 
274 aa  188  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 
272 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
272 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  41 
 
 
266 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
275 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.63 
 
 
274 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  42.41 
 
 
273 aa  185  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1291  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.83 
 
 
264 aa  185  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.98 
 
 
273 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  41.06 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.47 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  40.23 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  40.08 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  40.23 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.77 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
276 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.46 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.61 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.77 
 
 
277 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.14 
 
 
273 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  40.91 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
277 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.31 
 
 
278 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.46 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
277 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  39.08 
 
 
268 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
272 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
272 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
272 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  38.26 
 
 
274 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 
278 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  38.61 
 
 
259 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.72 
 
 
272 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.49 
 
 
284 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.04 
 
 
293 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.16 
 
 
276 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  37.59 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.18 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.54 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  38.15 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.93 
 
 
278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.17 
 
 
276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.94 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.21 
 
 
269 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.3 
 
 
276 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.68 
 
 
293 aa  171  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.29 
 
 
280 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.93 
 
 
277 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
303 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
304 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
281 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
274 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.02 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.02 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.83 
 
 
268 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.02 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
268 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  33.91 
 
 
293 aa  169  6e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.84 
 
 
274 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.43 
 
 
280 aa  168  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>