More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1761 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  51.33 
 
 		 643 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  100 
 
 		 642 aa  1318    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  56.63 
 
 		 631 aa  682    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  51.68 
 
 		 642 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  52.42 
 
 		 623 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  48.37 
 
 		 637 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 		 615 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  48.37 
 
 		 637 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  48.37 
 
 		 637 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 633 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  49.53 
 
 		 639 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  51.72 
 
 		 627 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  51.99 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 639 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  51.99 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 641 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  50.62 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  48.91 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  51.68 
 
 		 642 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  52.49 
 
 		 636 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  49.61 
 
 		 641 aa  618  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  50.86 
 
 		 637 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  50.62 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  48.99 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 646 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 636 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  49.01 
 
 		 653 aa  610  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 632 aa  609  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  49.3 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  49.07 
 
 		 649 aa  608  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 		 639 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  51.63 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  52.33 
 
 		 641 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  52.4 
 
 		 639 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  50.08 
 
 		 639 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  48.68 
 
 		 640 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  48.68 
 
 		 640 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  48.76 
 
 		 641 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  48.68 
 
 		 640 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  48.68 
 
 		 638 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  50.15 
 
 		 650 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  50 
 
 		 645 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  48.45 
 
 		 641 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  48.45 
 
 		 641 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  48.45 
 
 		 641 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  51.25 
 
 		 623 aa  600  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 		 637 aa  600  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  48.45 
 
 		 641 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2140  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 640 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  48.3 
 
 		 639 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  49.38 
 
 		 638 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25020  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 640 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  49.14 
 
 		 625 aa  594  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  49.23 
 
 		 640 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  47.27 
 
 		 647 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  48.54 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0171  ABC transporter-related protein  48.54 
 
 		 639 aa  593  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  50.24 
 
 		 632 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  49.84 
 
 		 628 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  48.21 
 
 		 637 aa  591  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  49.53 
 
 		 663 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  48.91 
 
 		 636 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  50.62 
 
 		 639 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  46.53 
 
 		 648 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  48.99 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  47.26 
 
 		 617 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  46.88 
 
 		 648 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  46.82 
 
 		 634 aa  585  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  48.36 
 
 		 636 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 		 636 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  46.95 
 
 		 617 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  47.28 
 
 		 635 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  47.19 
 
 		 642 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  46.66 
 
 		 635 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  47.28 
 
 		 635 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  47.28 
 
 		 635 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  47.28 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  47.46 
 
 		 649 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  47.38 
 
 		 642 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2477  ATPase  51.46 
 
 		 645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  48.53 
 
 		 641 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  47.28 
 
 		 635 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  47.12 
 
 		 636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  47.07 
 
 		 649 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  47.15 
 
 		 645 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 638 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  46.44 
 
 		 641 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  45.72 
 
 		 635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  46.66 
 
 		 635 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.5 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  46.5 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  46.5 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  46.5 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  46.5 
 
 		 635 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  46.5 
 
 		 635 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  47 
 
 		 661 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  47 
 
 		 649 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  46.53 
 
 		 649 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  47 
 
 		 661 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>