124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1728 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  27.24 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  30.83 
 
 		 307 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  27.35 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  29.44 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  30.51 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  25.76 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  28.99 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  27.82 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  28.89 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  27.84 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  29.88 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  26.94 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  28.91 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  27.32 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  26.54 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  26.41 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  27.32 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  27.32 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  27.45 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  25.7 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  24.41 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  25.38 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  28.26 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  26.18 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  29.17 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  26.15 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  25 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  25.98 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  28.89 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  26.39 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  30.62 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  32.21 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  29.06 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  25.89 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  25.89 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  25.71 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  24.05 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  26.34 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  23.02 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  29.72 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  25.67 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  25.94 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  27.67 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  25.62 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  25.85 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  29.22 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  26.27 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  27.4 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  24.52 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  24.49 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  29.28 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  26.24 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  30.24 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  30.43 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  25.44 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  27.91 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  29.63 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  31.33 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  26.74 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  25.97 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  25.63 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  25.63 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  29.1 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  25.29 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  25.94 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  25.58 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  26.54 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  23.56 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  28.09 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  26.83 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  22.22 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  23.19 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  26.14 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  22.66 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  28.38 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  25.11 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  26.44 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  27.2 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  22.67 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0894  Flp pilus assembly protein CpaB  24.29 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  23.3 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  24.64 
 
 		 315 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2311  Flp pilus assembly protein CpaB  22.62 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  28.93 
 
 		 390 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  26.09 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3515  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.21 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  23.6 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2778  SAF domain protein  28.93 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  22.96 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0305  SAF domain-containing protein  24.44 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  20.08 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  25.23 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  25.98 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  23.66 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  22.45 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1036  SAF domain protein  30.84 
 
 		 275 aa  45.8  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7221  Flp pilus assembly protein CpaB  33.68 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283104  normal  0.15855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  27.85 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>